高通量专题
文章分享：ctDNA高通量测序临床实践专家共识（2022年版）
【摘要】 循环肿瘤DNA（circulating tumor DNA，ctDNA）高通量测序在肿瘤临床诊疗中发挥越来越重要的作用，但其临床检测标准和应用范围尚缺乏统一认识。中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会组织相关专家，结合国内临床实践，参考国内外文献，从ctDNA生物学特征、检测影响因素，ctDNA高通量测序检测结果的临床应用价值和范围，以及ctDNA高通量测序检测体系的标准化建设等
【文献分享】freud 程序: 用于原子模拟数据的高通量分析
================================ 分享一篇用于原子模拟数据高通量分析的程序：freud 。 感谢论文的原作者！ ================================ 主要内容 “ freud 程序是一个用于分析仿真数据的库。考虑到现代模拟和数据分析工作流程，freud 提供了一个 Python 接口，用于在笔记本电脑、工
高通量蛋白筛选,科研利器—Luminex液相蛋白芯片
1、液相芯片技术的原理 液相芯片体系由许多大小均一的圆形微球（直径5.5～5.6 μm）为主要基质构成，每种微球上固定有不同的探针分子，将这些微球悬浮于一个液相体系中，就构成了一个液相芯片系统，利用这个系统可以对同一个样品中的多种不同分子同时进行检测，这种被称之为xMAP的检测技术是1997年由美国Luminex公司开发出来的。
【深度探索：高通量筛选技术在中药单体化合物中的创新应用及潜力”】
第一天上午 1.筛选策略基本原理及流程 1.运用全新筛选策略快速发现新药先导化合物 1.1全新筛选策略的基本原理 1.1.1基于药效团模型的虚拟筛选方法 1.1.2基于分子对接的虚拟筛选方法 1.1.3全新先导化合物的筛选方法 1.2全新筛选策略全新方法-用于先导化合物的快速发现 2.中药单体化合物数据库的构建 2…1二维数据库的构建和转换 2.2三维数据库的生成 2.3三维数据库的加氢加电荷和能
高通量PA770：PROTAC 体外泛素化检测试剂盒的应用
蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）已成为针对不可成药蛋白质组的新型疗法。PROTAC 是异双功能小分子，可同时结合靶蛋白和泛素 (Ub) E3 连接酶。这随后导致靶蛋白泛素化和降解。体外泛素化试剂盒的开发旨在建立一种高通量方法，通过监测蛋白质泛素化的内在能力来准确预测 PROTAC 效率。我们提供适用于三种 E3 泛素连接酶的试剂盒：Cereblon、VHL 和 HDM2，用于监测所选靶标的 PR
植株计数-密度估计-从高分辨率RGB图像中快速实现高通量植物计数
TasselNetv2+ TasselNetv2+亮点安装准备数据推断训练使用自己的数据集引用 TasselNetv2+ 该存储库包含TasselNetv2+用于植物计数的官方实现，详见论文： TasselNetv2+: A Fast Implementation for High-Throughput Plant Counting from High-Resolution
使用vsearch进行16s扩增子高通量序列分析步骤
1、vsearch分析工具介绍： VSEARCH是一个开源免费的64位，无内存限制的扩增子数据处理分析软件。（点到为止，其他的建议大家参考原文献和网站) github：GitHub - torognes/vsearch: Versatile open-source tool for microbiome analysis 最新文献：Edgar
NGS项目四：高通量测序在植物生物胁迫研究中的应用
在植物生物胁迫研究方面，本文通过作者所精密相关课题组的研究，比较传统研究方法和高通量测序方法的优劣。 Sun X, Tan Q, Nie Z,et al. Differential Expression of Proteins in Response to MolybdenumDeficiency in Winter Wheat Leaves Under Low-Temperature
通过高通量测序评估金针菇（双孢蘑菇）生产过程中的微生物演替
1.1 Title:Microbial succession during button mushroom (Agaricus bisporus) production evaluated via high-throughput sequencing 1.2 作者：Ban Ga-Hee 1.3 机构：Ewha Womans University 1.4 期刊：Food Microbiol
linux下载sra数据库,从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据
用别人的数据，发自己的文章 由于大多数杂志在文章发表前要求公开数据，所以随着测序文章的爆发，NCBI的SRA数据库当中积累了海量的测序数据。我们可以利用这些数据重新做数据挖掘，发表新的文章。 官方下载方法不太稳 要利用数据，首先得下载得到数据，虽然SRA数据库提供的SRA Toolkit 工具包里的prefetch可以下载，但是用这个方法下载数据需要经过复杂的设置，而且经常莫名奇妙的下不了，总的
linux下载sra数据库,从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据
用别人的数据，发自己的文章 由于大多数杂志在文章发表前要求公开数据，所以随着测序文章的爆发，NCBI的SRA数据库当中积累了海量的测序数据。我们可以利用这些数据重新做数据挖掘，发表新的文章。 官方下载方法不太稳 要利用数据，首先得下载得到数据，虽然SRA数据库提供的SRA Toolkit 工具包里的prefetch可以下载，但是用这个方法下载数据需要经过复杂的设置，而且经常莫名奇妙的下不了，总的
计算机辅助高通量虚拟筛选的技术笔记巩固知识要点
高通量虚拟筛选技术是一种基于高通量实验技术开展的高效筛选方法，能够极大提高样品处理和分析的速度和精度，成为众多领域的重要工具。由于传统实验室药物发现成本高、效率低，迫切需要一种虚拟药物筛选模型，对海量化合物进行高通量筛选。 计算机辅助药物设计可以提高药物研发的成功率，降低研发成本，缩短研发周期，是目前创新药物研究的核心技术之一。随着医药大数据的积累和人工智能技术的发展，运用AI技术并结合大数据的
高通量数据的多重检验问题
高通量数据的多重检验问题 主页 关于 笔记 简历 留言板 RSS 各种组学分析技术的进展导致了我们在收集数据时更侧重数据信息的保存，然而我们收集的数据最终也会根据我们的想探索的问题来寻找答案，甚至有时候我们在实验设计分组时就打算考察某一个变量而为了获取更多的相关信息而采用了组学技术。这点是尤其要强调的，科研人员一定是面向科学问题解决科学问题，而不要为了应用新技术而应用新技术。当然，现实的情况是