本文主要是介绍NGS项目四:高通量测序在植物生物胁迫研究中的应用,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
在植物生物胁迫研究方面,本文通过作者所精密相关课题组的研究,比较传统研究方法和高通量测序方法的优劣。
Sun X, Tan Q, Nie Z,et al. Differential Expression of Proteins in Response to MolybdenumDeficiency in Winter Wheat Leaves Under Low-Temperature Stress[J].Plant Molecular Biology Reporter, 2014, 32(5):1057-1069.
讨论:
本研究揭示了在正常和寒冷条件下冬小麦钼缺乏所造成蛋白组的改变。我们鉴定了13个钼调节蛋白位点,5个参与到光合作用光反应,5个参与到光合作用暗反应,3个高度参与到RNA结合和蛋白合成。
钼在低温胁迫下参与光反应
这5个参与光合作用光反应的蛋白位点被鉴定为cytochromeb6-f铁—硫亚基。蛋白可能存在于超过一个的位点,可能是因为翻译后转移,例如磷酸化影响蛋白的pI值。在光合作用的光反应阶段,cytochromeb6-f复合物的功能师调节电子在两个光合作用反应中心复合体间的转移,从PSII到PSI.我们推测钼调节cytochromeb6-f磷酸化复合铁-硫亚基然后调节在低温下的光反应中的电子转运。同时b6-f复合体表现出参与到叶绿素合成。B5,一个光捕获叶绿体a/b结合蛋白,是在植物中丰度最大的叶绿体蛋白。它的主要功能师收集和转运光能到光反应中心。几个研究推测,光捕获叶绿体a/b-结合蛋白解压在胁迫条件下,如冷害、高度盐质、干旱时下调,并产生甲醛.
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