【论文详读】Predicting Retrosynthetic Reaction using Self-Corrected Transformer Neural Networks

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数据预处理

把数据分为十大类,然后根据聚类来划分数据。
在文中,使用二维相似指纹来测量目标产品之间的拓扑相似性,并使用常用的Bemis-Murcko原子框架来聚类产品,相似阈值取0.6。

模型

在这里插入图片描述

模型分为两步:
1)利用训练模型对反应物进行预测;
2)根据语法校正预测反应物。
构建了一个基于transformer的语法校正器,来自动校正不合理的smiles语法,以提高模型的准确性。
(值得注意的是,相当于整个模型有两个transformer,一个是预测反应物,一个校正语法)
在这里插入图片描述
最后只保留校正后的top-1作为预测结果。

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