生物学专题

机器学习如何助力网络生物学

机器学习如何助力网络生物学 1. 生物网络的构建与推断 2. 网络分析与特征提取 3. 疾病网络与个性化医疗 4. 多组学数据整合 5. 动态网络与时间序列分析 6. 网络的可视化与解释 7. 应对数据噪声与不确定性 8. 挑战与未来展望 🎈边走、边悟🎈迟早会好机器学习在网络生物学中的应用具有重要意义，能够帮助科学家处理和分析大规模的生物数据，揭示生物系统中的

数学生物学-4-混乱系统(Chaotic Systems)

混沌系统（Chaotic Systems）是一种复杂且非线性的动态系统，其基本概念和特征有：对初始条件的敏感依赖性：混沌系统的核心特征之一是对初始条件的极端敏感性，这一特性通常被称为“蝴蝶效应”。这意味着即使是极其微小的差异在初始状态也可能随时间放大，导致系统行为的显著不同。例如，天气预报模型中微小误差的累积可能导致长期预测的显著偏差。这种敏感性使得混沌系统的确切长期行为变得难以预测。

建议收藏 | 2023年生物学类SCI期刊影响因子最新预测，Molecular Plant遥遥领先

公众号：生信漫谈，获取最新科研信息！建议收藏 | 2023年生物学类SCI期刊影响因子最新预测，Molecular Plant遥遥领先https://mp.weixin.qq.com/s/tFINUzZ1l4H9x1HWTq1kFg 2023年生物学类SCI期刊影响因子最新预测，Molecular Plant遥遥领先，植物经典期刊Plant Phy

【C++风云录】揭示生命演变的秘密:海洋生物学与水生生态学

赋能海洋生物研究：揭秘实用软件库前言在我们的世界中，生物信息学和化学信息学已经成为理解生态系统、基因组学、分子进化和化学数据等关键领域的重要工具。本文将介绍和比较六个适用于这些领域的主要软件开发包(SDK)：EcoOcean、MarLIN、Mothur、Bio++、SeqAn 和 Open Babel。欢迎订阅专栏：C++风云录文章目录赋能海洋生物研究：揭秘实用软件

SH-PEG-SH，聚乙二醇二巯基广泛用于生物学应用、纳米技术和材料研究中

【试剂详情】英文名称 SH-PEG-SH 中文名称聚乙二醇二巯基，双硫醇PEG，双巯基聚乙二醇，双巯基封端聚乙二醇外观性状白色固体粉末分子量 0.4k，0.6k，1k，2k，3.4k，5k，10k（可定制）分子式 HSCH2CH2（CH2CH2O）nCH2CH2SH 溶解性溶于水，溶于DMF、DMSO等部分有机溶液规格可按需包装定制纯度

“它将改变一切”，DeepMind AI解决生物学50年来重大挑战，破解蛋白质分子折叠问题...

来源：机器之心本文约3800字，建议阅读9分钟 AlphaFold 2，128块TPU大力出奇迹，让别人无路可走。 CASP14 组织者、年近七旬的 UC Davis 科学家 Andriy Kryshtafovych 在大会上感叹道，I wasn't sure that I would live long enough to see this（我活久见了）[1]。 11 月 30 日，一条重

考研复试细胞生物学3.细胞骨架(交通网络)

细胞骨架可以被比喻为城市的交通网络系统。就像城市的交通网络由道路、桥梁和隧道组成，确保人员和物资的流动一样，细胞骨架由微丝、微管和中间纤维组成，负责维持细胞的形状、提供机械支持、确保细胞内物质的运输和细胞的运动。微丝类似于城市的街道和小巷，它们是细胞骨架中最细小的组成部分，但数量众多，为细胞提供机械强度和形状。微管则可以比作高速公路，它们是细

PSP - 结构生物学中的机器学习 (NIPS MLSB Workshop 2023.12)

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/135120094 Machine Learning in Structural Biology (机器学习在结构生物学中) 网址：https://www.mlsb.io/ Workshop at the

Python CalmAn(Calcium Imaging Analysis)神经生物学工具包安装及环境配置过程

文章目录 CalmAn简介安装要求我的设备 1>CalmAn压缩包解压（caiman文件夹要改名）2>conda创建虚拟环境3>requirements依赖包配置（包括tensorflow）4>caiman安装(mamba install)5>caimanmanager.py install6>PyCharm添加解释器7>Demo演示8>遇到的问题本篇完成了基于 Windows

A-Level生物学练习（第1章、细胞结构和组织 Cell Structure and Organisation）

本章封面： Work Example: Checkpoint: Answer: B. Cell Explanation: A cell is the basic unit of life as it is the simplest unit which makes up a living thing. Answer(s): Chloroplast; Mitochondr

Nat Commun | 性能优于传统生物标志物！基于网络生物学的机器学习方法可准确预测癌症患者免疫治疗反应...

免疫疗法通过激活人体的免疫系统来对抗癌细胞，主要包括免疫检查点抑制剂（ICI）、过继性细胞转移疗法（ACT）、肿瘤特异性疫苗等。与传统抗癌药物相比，其副作用较小。此外，免疫疗法还可以利用免疫系统的记忆和适应性，使受益于该疗法的患者能够获得持续的抗癌效果。近年来，ICI极大地改善了癌症患者的临床治疗、提高了患者的生存率。但目前只有少数患者（约占30%实体肿瘤患者）可以从中受益，绝大多数患者对I

NBR最新：多模态数据融合下人际神经同步的神经生物学基础

导读人类彼此同步以促进成功的互动。在这里，本研究使用了一种多模态数据融合方法，旨在阐明人际神经同步（INS）发生的神经生物学机制。本研究对22项fMRI和69项fNIRS超扫描实验（分别为740名和3721名被试）的元分析显示，INS在右侧颞顶交界处和左腹侧前额叶皮层存在稳定的脑区相关性。将这些元分析信息与公共数据库、生物行为和脑功能关联分析相结合发现，INS涉及与心智化和注意力网络有功能连接

生物学笔记一（神经学 VS Robot）

以下文章皆来自个人平时阅读生物学书籍的摘要笔记：个人保留原创版权，转载请注明出处http://blog.csdn.net/human_evolution 内容看似简单，但是当你正真去做一个机器人时，你会发现简单的知识带来的灵感是巨大的！个人觉得生物学可以给我们做技术的提供灵感和思路，加上自己也比较感兴趣就看看，有同样兴趣的朋友大家交流。 1、人的神经系统分两种细胞：神经元和神

【哈佛大学生物信息学与计算生物学】视频笔记

目录生物信息学研究浪潮Bioinfo vs Computational BiologyLevels of Bioinfo / Comp Bio生物信息学相关学科 & 技术FASTQ Filefastqc对原始测序reads质控Per Base Sequence QualityPer Sequence Quality DistributionNucleotide Content Per Po

薛逸凡计算机生物学,北大女孩，古生物独苗，10年后转行AI，选择冷门专业真的会后悔吗...

绝大部分考上名校的学生，几乎都怀揣着自己的梦想。至于考入清华北大这个级别的顶级名校学生，理想更是远大。很多学生并不计较专业，相当部分人认为，在清华北大这个级别的“金字招牌”下，哪有什么冷门专业，考入清北，已经足以证明自己的能力。 2010级的女孩薛逸凡，显然也是这么想的，她选择是北大的古生物专业，这可能是我国唯一的只有一个学生的专业。这个专业差不多每个年级都有一人，仅有一届学生打破了纪录，

医疗器械生物学评价系列标准

医疗器械生物学评价系列标准(GB/T 16886/ISO 10993)是保障医疗器械安全的基础标准，内容涵盖医疗器械生物学评价基本指导原则、各项生物学试验方法、样品制备方法、理化表征方法等，是医疗器械生物学试验、评价、技术审批的重要依据，是医疗器械研发、生产、检验、审评及使用人员进行生物学评价的基本遵循。医疗器械生物学评价系列标准之现行标准有19个，即将实施的有7个，如下：现行标准：

从生物学的角度对中间件和构件的思考

软件发展现状软件开发是典型的知识密集型、复杂度高、开发周期长、可靠性保证难的活动。随着软件应用范围的迅速扩大，以及软件运行平台从单机到网络环境的转变，软件的规模越来越大，复杂性越来越高，这将导致软件在反映对象、开发基础、关注内容、运行方式、提交形式开销比重等方面的重要发展。从个体计算过程到群体合作过程的发展；由电子服务延伸到现代服务；从以单个软件开发为主向以集成开发为主的顺延；从以产品为

华师大计算机学院张伟,华东师范大学生物学实践工作站第四期正式开班

2019年5月12日上午，华东师范大学生物学实践工作站2019年度第四期学员开学典礼在华东师范大学闵行校区生命科学学院534报告厅举行。来自上海市延安中学、文来中学、华东师范大学附属第一中学和华东师范大学附属第二中学四所实践点的120名优秀学员带着好奇心走进了华东师范大学的校园。华东师范大学生命科学学院副院长江文正教授、华东师范大学生物学实践工作站站长赵云龙教授、华东师范大学生命科学实验教学中

【国科大——期末复习】系统与进化生物学 (葛颂)_期末复习思考题答案

系统与进化生物学目录第一章系统与进化生物学概述一、基础知识： Taxonomy 分类学； Systematics 系统学； Systematic and Evolutionary Biology系统与进化生物学主要研究内容：分类Classification，系统发生Phylogeny，进化EvolutionPaeonia suffruticosa Andrews 牡丹

Biotin-PEG4-NH-CH2CH2-4-Phenol具有多种生物学功能

Biotin-PEG4-NH-CH2CH2-4-Phenol是一种化学物质，它是由生物素、PEG4和苯酚基组成的。生物素是一种重要的维生素，它在生物体内具有多种重要的生物学功能，如参与蛋白质、脂肪和碳水化合物代谢等。PEG4是一种聚乙二醇，它具有优异的生物相容性和生物稳定性，在生物医学领域有广泛的应用。苯酚基则是一种含有苯环和羟基的有机化合物，它具有良好的溶解性和生物活性，可以用于生物分析和药物研

2023上海国际计算生物学创新大赛——药物筛选AI算法“凌越”挑战赛，等你来战！

作为一门新兴的交叉学科，计算生物学具有巨大的应用潜力和市场价值。近年来，各国高度重视计算生物学的发展，尝试利用计算生物学的方法和技术破解生物医药行业的难题。为进一步推动计算生物学发展，落实《上海市计算生物学创新发展行动计划（2023—2025年）》，2023上海国际计算生物学创新大赛——药物筛选AI算法“凌越”挑战赛于日前正式启动。本次大赛面向全球社会各界开放，不限年龄、国籍，各高等院校

PSP - 结构生物学中的机器学习 (NIPS MLSB Workshop 2023.12)

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/135120094 Machine Learning in Structural Biology (机器学习在结构生物学中) 网址：https://www.mlsb.io/ Workshop at the

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给合成生物学的一次预警：当心计算机黑客的“恶意DNA入侵”

华盛顿大学蛋白质设计研究所的科学家正在使用该软件来建模和创建新疫苗。图片出处：INSTITUTE FOR PROTEIN DESIG 本文作者：武文浩每一年，商业 DNA 合成产业每年都会向订购者交付数十亿核苷酸（nucleotides），成交额高达数亿美元，而随着 DNA 合成在相关领域内变得越来越普遍，有没有什么重要的事情是被忽略的？在 Nature Biotechnology

最近3篇蛋白质及其组学知识图谱Nature子刊文章解决生物学核心问题

第一篇文章 2022年1月31日Alberto Santos 最新发表在《自然生物技术》上的文章 ” A knowledge graph to interpret clinical proteomics data”. 针对生物医学数据数量大、种类丰富而带来的数据整合困难，该工作提出了一个开源的临床知识图谱平台CKG(Clinical Knowledge Graph), 该平台结合了统计和机器学习

2024上海国际合成生物学与绿色生物制造展览会8月7-9号上海举办

2024年8月7日至9日，一场生物制造领域的盛会将在上海新国际博览中心闪亮登场。那就是2024上海国际合成生物学与绿色生物制造展览会。这场盛会将同期举办2024第13届上海国际生物发酵展，形成了一个强大的“生物军团”，展现出生物科技领域的无限魅力。这个展览会得到了国家合成生物技术创新中心和中国生物工程学会的大力支持，就像一颗璀璨的明星在生物科技领域中熠熠生辉。而主办单位中国生物发酵产业协会则像