本文主要是介绍【VASP】POSCAR文件,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
【VASP】POSCAR文件
前言
一、4个常用的输入文件INCAR、POSCAR、POTCAR、KPOINTS
INCAR: 计算任务类型是什么?怎么计算?
KPOINTS: 包含了倒易空间点网格的坐标和权重。
POSCAR: 包含元胞的原子坐标信息以及初始速度等信息。
POTCAR: 超软赝势或PAW势函数(有一个赝势库)。
POSCAR文件:位置文件。描述所计算体系的晶胞参数、原子个数及晶胞中原子的位置,以及分子动力学计算时原子的初始速度。
POSCAR文件示例:
Si-fcc5.430.00.50 0.500.50 0.00 0.500.50 0.50 0.00Si2Direct0.00.00 0.000.25 0.25 0.25
POSCAR文件的结构:
第1行:任意文字注释。
第2行:晶胞的扩展系数,一般1.0即可。一般在做晶胞体积和能量关系曲线中用到, 在其他计算中很少用。(Eg:这一行写成1.1,代表下面的晶胞的a,b,c矢量和所有的原子坐标都要乘以1.1);
第3-5行:定义晶矢,是格子在三个方向上的晶格矢量信息。(Eg: 4.72 0.0 0.0 ,代表晶胞的a边是垂直于y和z坐标轴的,在x方向上长4.72个埃);
第6行:元素符号,如有多个原子则依次用空格隔开。(Eg:Al O);特别注意顺序,要与下面的坐标顺序以及POTCAR中的顺序一致。
第7行:对应第六行元素原子的数目,注意是一一对应的;
第8行:坐标的表达形式,同KPOINTS的第三行,只认第一个字母, C或者c代表笛卡尔坐标, D或者d代表分数坐标系Direct, 值得注意的是,VASP输出文件CONTCAR 里面采用的是分数坐标系。两个坐标系的区别从第8行开始,前面的七行都保持 完全一致。 也就是说,如果想实现两个坐标系之间转换,我们只需改变第7行后面的部分即可;这个也可以用VESTA完成。
第9行及以后行数:原子的坐标。
这篇关于【VASP】POSCAR文件的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!