全外显子测序分析流程3 - Exon.Interval.bed文件生成和BAM文件标记重复

2024-09-01 11:52

本文主要是介绍全外显子测序分析流程3 - Exon.Interval.bed文件生成和BAM文件标记重复,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

全外显子测序分析流程3 - Exon.Interval.bed文件生成和BAM文件标记重复

分析流程步骤其他相关文章:

Python处理生信分析流程配置文件4种方法

全外显子测序分析流程1 - Fastq质控与去接头、低质量和引物序列

全外显子测序分析流程2 - BWA-MEM比对到参考基因组与BAM统计

1. 封装流程特点

  1. python封装, 参数控制
  2. 配置文件设置核心参数,便于全流程控制

2. 运行示例

####### Exon.Interval.bed文件生成 ######
# -s: 样本名称<

这篇关于全外显子测序分析流程3 - Exon.Interval.bed文件生成和BAM文件标记重复的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1126862

相关文章

Java实战之利用POI生成Excel图表

《Java实战之利用POI生成Excel图表》ApachePOI是Java生态中处理Office文档的核心工具,这篇文章主要为大家详细介绍了如何在Excel中创建折线图,柱状图,饼图等常见图表,需要的... 目录一、环境配置与依赖管理二、数据源准备与工作表构建三、图表生成核心步骤1. 折线图(Line Ch

Linux流媒体服务器部署流程

《Linux流媒体服务器部署流程》文章详细介绍了流媒体服务器的部署步骤,包括更新系统、安装依赖组件、编译安装Nginx和RTMP模块、配置Nginx和FFmpeg,以及测试流媒体服务器的搭建... 目录流媒体服务器部署部署安装1.更新系统2.安装依赖组件3.解压4.编译安装(添加RTMP和openssl模块

Springboot中分析SQL性能的两种方式详解

《Springboot中分析SQL性能的两种方式详解》文章介绍了SQL性能分析的两种方式:MyBatis-Plus性能分析插件和p6spy框架,MyBatis-Plus插件配置简单,适用于开发和测试环... 目录SQL性能分析的两种方式:功能介绍实现方式:实现步骤:SQL性能分析的两种方式:功能介绍记录

0基础租个硬件玩deepseek,蓝耘元生代智算云|本地部署DeepSeek R1模型的操作流程

《0基础租个硬件玩deepseek,蓝耘元生代智算云|本地部署DeepSeekR1模型的操作流程》DeepSeekR1模型凭借其强大的自然语言处理能力,在未来具有广阔的应用前景,有望在多个领域发... 目录0基础租个硬件玩deepseek,蓝耘元生代智算云|本地部署DeepSeek R1模型,3步搞定一个应

最长公共子序列问题的深度分析与Java实现方式

《最长公共子序列问题的深度分析与Java实现方式》本文详细介绍了最长公共子序列(LCS)问题,包括其概念、暴力解法、动态规划解法,并提供了Java代码实现,暴力解法虽然简单,但在大数据处理中效率较低,... 目录最长公共子序列问题概述问题理解与示例分析暴力解法思路与示例代码动态规划解法DP 表的构建与意义动

浅析如何使用Swagger生成带权限控制的API文档

《浅析如何使用Swagger生成带权限控制的API文档》当涉及到权限控制时,如何生成既安全又详细的API文档就成了一个关键问题,所以这篇文章小编就来和大家好好聊聊如何用Swagger来生成带有... 目录准备工作配置 Swagger权限控制给 API 加上权限注解查看文档注意事项在咱们的开发工作里,API

springboot启动流程过程

《springboot启动流程过程》SpringBoot简化了Spring框架的使用,通过创建`SpringApplication`对象,判断应用类型并设置初始化器和监听器,在`run`方法中,读取配... 目录springboot启动流程springboot程序启动入口1.创建SpringApplicat

Java使用POI-TL和JFreeChart动态生成Word报告

《Java使用POI-TL和JFreeChart动态生成Word报告》本文介绍了使用POI-TL和JFreeChart生成包含动态数据和图表的Word报告的方法,并分享了实际开发中的踩坑经验,通过代码... 目录前言一、需求背景二、方案分析三、 POI-TL + JFreeChart 实现3.1 Maven

通过prometheus监控Tomcat运行状态的操作流程

《通过prometheus监控Tomcat运行状态的操作流程》文章介绍了如何安装和配置Tomcat,并使用Prometheus和TomcatExporter来监控Tomcat的运行状态,文章详细讲解了... 目录Tomcat安装配置以及prometheus监控Tomcat一. 安装并配置tomcat1、安装

MySQL的cpu使用率100%的问题排查流程

《MySQL的cpu使用率100%的问题排查流程》线上mysql服务器经常性出现cpu使用率100%的告警,因此本文整理一下排查该问题的常规流程,文中通过代码示例讲解的非常详细,对大家的学习或工作有一... 目录1. 确认CPU占用来源2. 实时分析mysql活动3. 分析慢查询与执行计划4. 检查索引与表