代谢组数据分析(十九):随机森林构建代谢组预后模型

2024-08-27 12:20

本文主要是介绍代谢组数据分析(十九):随机森林构建代谢组预后模型,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在这里插入图片描述

介绍

建立胃癌(GC)预后模型时,从队列3中的181名患者中,使用右删失结果数据进行了随机分层抽样,分为训练数据集(n = 121)和测试数据集(n = 60)。训练了一个包含1000棵树的随机生存森林(RSF)模型,根据它们基于排列的特征重要性来选择突出的特征。通过再次训练随机生存模型,并选取28种代谢物,建立了显示出色预测能力(AUROC = 0.832,95% CI:0.697-0.951)的最佳模型,用于预测测试数据集中GC患者的生存结果。

此外,还利用单变量Cox回归分析中与患者结果显著相关的临床特征,包括TNM分期、宏观表现和血管肿瘤栓塞,分别或组合训练RSF模型。还拟合了综合RSF模型(28种代谢物特征与临床参数结合),以预测患者的结果。通过C指数在测试数据集上评估了模型性能。

对于个体结果预测,样本在森林中的每棵树上都按照对数秩检验的分裂标准下降,直到到达一个终端节点。每个终端节点中的数据用于非参数地估计生存和累积危险函数,分别使用Kaplan-Mei

这篇关于代谢组数据分析(十九):随机森林构建代谢组预后模型的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1111651

相关文章

Python中随机休眠技术原理与应用详解

《Python中随机休眠技术原理与应用详解》在编程中,让程序暂停执行特定时间是常见需求,当需要引入不确定性时,随机休眠就成为关键技巧,下面我们就来看看Python中随机休眠技术的具体实现与应用吧... 目录引言一、实现原理与基础方法1.1 核心函数解析1.2 基础实现模板1.3 整数版实现二、典型应用场景2

Java的IO模型、Netty原理解析

《Java的IO模型、Netty原理解析》Java的I/O是以流的方式进行数据输入输出的,Java的类库涉及很多领域的IO内容:标准的输入输出,文件的操作、网络上的数据传输流、字符串流、对象流等,这篇... 目录1.什么是IO2.同步与异步、阻塞与非阻塞3.三种IO模型BIO(blocking I/O)NI

一文详解如何从零构建Spring Boot Starter并实现整合

《一文详解如何从零构建SpringBootStarter并实现整合》SpringBoot是一个开源的Java基础框架,用于创建独立、生产级的基于Spring框架的应用程序,:本文主要介绍如何从... 目录一、Spring Boot Starter的核心价值二、Starter项目创建全流程2.1 项目初始化(

使用Java实现通用树形结构构建工具类

《使用Java实现通用树形结构构建工具类》这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用Java实现通用树形结构构建工具类,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录完整代码一、设计思想与核心功能二、核心实现原理1. 数据结构准备阶段2. 循环依赖检测算法3. 树形结构构建4. 搜索子

基于Flask框架添加多个AI模型的API并进行交互

《基于Flask框架添加多个AI模型的API并进行交互》:本文主要介绍如何基于Flask框架开发AI模型API管理系统,允许用户添加、删除不同AI模型的API密钥,感兴趣的可以了解下... 目录1. 概述2. 后端代码说明2.1 依赖库导入2.2 应用初始化2.3 API 存储字典2.4 路由函数2.5 应

使用Python和python-pptx构建Markdown到PowerPoint转换器

《使用Python和python-pptx构建Markdown到PowerPoint转换器》在这篇博客中,我们将深入分析一个使用Python开发的应用程序,该程序可以将Markdown文件转换为Pow... 目录引言应用概述代码结构与分析1. 类定义与初始化2. 事件处理3. Markdown 处理4. 转

Java使用Mail构建邮件功能的完整指南

《Java使用Mail构建邮件功能的完整指南》JavaMailAPI是一个功能强大的工具,它可以帮助开发者轻松实现邮件的发送与接收功能,本文将介绍如何使用JavaMail发送和接收邮件,希望对大家有所... 目录1、简述2、主要特点3、发送样例3.1 发送纯文本邮件3.2 发送 html 邮件3.3 发送带

Python结合Flask框架构建一个简易的远程控制系统

《Python结合Flask框架构建一个简易的远程控制系统》这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用Python与Flask框架构建一个简易的远程控制系统,能够远程执行操作命令(如关机、重启、锁屏等),还... 目录1.概述2.功能使用系统命令执行实时屏幕监控3. BUG修复过程1. Authorization

C#集成DeepSeek模型实现AI私有化的流程步骤(本地部署与API调用教程)

《C#集成DeepSeek模型实现AI私有化的流程步骤(本地部署与API调用教程)》本文主要介绍了C#集成DeepSeek模型实现AI私有化的方法,包括搭建基础环境,如安装Ollama和下载DeepS... 目录前言搭建基础环境1、安装 Ollama2、下载 DeepSeek R1 模型客户端 ChatBo

SpringBoot快速接入OpenAI大模型的方法(JDK8)

《SpringBoot快速接入OpenAI大模型的方法(JDK8)》本文介绍了如何使用AI4J快速接入OpenAI大模型,并展示了如何实现流式与非流式的输出,以及对函数调用的使用,AI4J支持JDK8... 目录使用AI4J快速接入OpenAI大模型介绍AI4J-github快速使用创建SpringBoot