STAR-Echo:一种使用时空分析和基于Transformer的影像组学模型预后慢性肾脏病患者 MACE 预后的新型生物标志物

本文主要是介绍STAR-Echo:一种使用时空分析和基于Transformer的影像组学模型预后慢性肾脏病患者 MACE 预后的新型生物标志物,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

文章目录

  • STAR-Echo: A Novel Biomarker for Prognosis of MACE in Chronic Kidney Disease Patients Using Spatiotemporal Analysis and Transformer-Based Radiomics Models
    • 摘要
    • 方法
    • 实验结果

STAR-Echo: A Novel Biomarker for Prognosis of MACE in Chronic Kidney Disease Patients Using Spatiotemporal Analysis and Transformer-Based Radiomics Models

摘要

慢性肾脏病(CKD)患者患有主要不良心血管事件(MACE)的风险较高。超声心动图评估左心室(LV)功能和心脏异常。LV壁(LVW)的病理生理学和收缩期/舒张期功能与CKD患者的MACE结果(O-和O+)相关联。然而,传统的基于LV容积的测量,如射血分数,其预测价值有限,因为它们仅依赖于末期帧。

我们假设通过时空分析,对比分析LVW的形态可以预测CKD患者的MACE风险。然而,由于噪声、分辨率低和需要手动干预,准确地描绘和分析每个帧的LVW是具有挑战性的。

本文包括:
(a)开发一个自动化流水线,用于识别和标准化心跳周期,并分割LVW;
(b)引入一个新颖的计算生物标志物—STAR-Echo—它结合了来自放射组学(MR)和深度学习(MT)模型的时空风险,用于预测CKD患者的MACE预后;
(c)证明了与MR、MT以及临床生物标志物(EF、BNP和NT-proBNP)相比,STAR-Echo具有更优越的预后性能,用于表征心脏功能障碍。STAR-Echo捕获了LVW的灰度级分布、周长和球度,这些在遭受MACE结果的个体中随时间变化不同。

STAR-Echo在MACE结果分类方面实现了0.71 [0.53−0.89]的AUC,并在一个CKD患者的保留队列(Sv = 44,N = 150)上展示了在Kaplan-Meier生存分析中的预测能力。与MR(p值=0.042)、MT(p值=0.069)和临床生物标志物—EF、BNP和NT-proBNP(p值>0.05)相比,它实现了更优越的MACE预测能力(p值=0.037(对数秩检验))
代码地址

方法

在这里插入图片描述
Fig. 1. 时空分析和STAR-Echo的工作流程:STAR-Echo将来自时空模型MR和MT的互补预测进行融合。输入的超声视频经过预处理,以识别在2个舒张末期(ED)帧之间的心跳周期。所有超声视频都被标准化为30帧。分割和蒙版的LVW视频被输入到MR和MT管道中。

实验结果

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

这篇关于STAR-Echo:一种使用时空分析和基于Transformer的影像组学模型预后慢性肾脏病患者 MACE 预后的新型生物标志物的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/994771

相关文章

0基础租个硬件玩deepseek,蓝耘元生代智算云|本地部署DeepSeek R1模型的操作流程

《0基础租个硬件玩deepseek,蓝耘元生代智算云|本地部署DeepSeekR1模型的操作流程》DeepSeekR1模型凭借其强大的自然语言处理能力,在未来具有广阔的应用前景,有望在多个领域发... 目录0基础租个硬件玩deepseek,蓝耘元生代智算云|本地部署DeepSeek R1模型,3步搞定一个应

SpringBoot中使用 ThreadLocal 进行多线程上下文管理及注意事项小结

《SpringBoot中使用ThreadLocal进行多线程上下文管理及注意事项小结》本文详细介绍了ThreadLocal的原理、使用场景和示例代码,并在SpringBoot中使用ThreadLo... 目录前言技术积累1.什么是 ThreadLocal2. ThreadLocal 的原理2.1 线程隔离2

Python itertools中accumulate函数用法及使用运用详细讲解

《Pythonitertools中accumulate函数用法及使用运用详细讲解》:本文主要介绍Python的itertools库中的accumulate函数,该函数可以计算累积和或通过指定函数... 目录1.1前言:1.2定义:1.3衍生用法:1.3Leetcode的实际运用:总结 1.1前言:本文将详

Deepseek R1模型本地化部署+API接口调用详细教程(释放AI生产力)

《DeepseekR1模型本地化部署+API接口调用详细教程(释放AI生产力)》本文介绍了本地部署DeepSeekR1模型和通过API调用将其集成到VSCode中的过程,作者详细步骤展示了如何下载和... 目录前言一、deepseek R1模型与chatGPT o1系列模型对比二、本地部署步骤1.安装oll

最长公共子序列问题的深度分析与Java实现方式

《最长公共子序列问题的深度分析与Java实现方式》本文详细介绍了最长公共子序列(LCS)问题,包括其概念、暴力解法、动态规划解法,并提供了Java代码实现,暴力解法虽然简单,但在大数据处理中效率较低,... 目录最长公共子序列问题概述问题理解与示例分析暴力解法思路与示例代码动态规划解法DP 表的构建与意义动

浅析如何使用Swagger生成带权限控制的API文档

《浅析如何使用Swagger生成带权限控制的API文档》当涉及到权限控制时,如何生成既安全又详细的API文档就成了一个关键问题,所以这篇文章小编就来和大家好好聊聊如何用Swagger来生成带有... 目录准备工作配置 Swagger权限控制给 API 加上权限注解查看文档注意事项在咱们的开发工作里,API

Spring AI Alibaba接入大模型时的依赖问题小结

《SpringAIAlibaba接入大模型时的依赖问题小结》文章介绍了如何在pom.xml文件中配置SpringAIAlibaba依赖,并提供了一个示例pom.xml文件,同时,建议将Maven仓... 目录(一)pom.XML文件:(二)application.yml配置文件(一)pom.xml文件:首

Java数字转换工具类NumberUtil的使用

《Java数字转换工具类NumberUtil的使用》NumberUtil是一个功能强大的Java工具类,用于处理数字的各种操作,包括数值运算、格式化、随机数生成和数值判断,下面就来介绍一下Number... 目录一、NumberUtil类概述二、主要功能介绍1. 数值运算2. 格式化3. 数值判断4. 随机

Spring排序机制之接口与注解的使用方法

《Spring排序机制之接口与注解的使用方法》本文介绍了Spring中多种排序机制,包括Ordered接口、PriorityOrdered接口、@Order注解和@Priority注解,提供了详细示例... 目录一、Spring 排序的需求场景二、Spring 中的排序机制1、Ordered 接口2、Pri

Springboot 中使用Sentinel的详细步骤

《Springboot中使用Sentinel的详细步骤》文章介绍了如何在SpringBoot中使用Sentinel进行限流和熔断降级,首先添加依赖,配置Sentinel控制台地址,定义受保护的资源,... 目录步骤 1: 添加 Sentinel 依赖步骤 2: 配置 Sentinel步骤 3: 定义受保护的