STAR-Echo:一种使用时空分析和基于Transformer的影像组学模型预后慢性肾脏病患者 MACE 预后的新型生物标志物

本文主要是介绍STAR-Echo:一种使用时空分析和基于Transformer的影像组学模型预后慢性肾脏病患者 MACE 预后的新型生物标志物,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

文章目录

  • STAR-Echo: A Novel Biomarker for Prognosis of MACE in Chronic Kidney Disease Patients Using Spatiotemporal Analysis and Transformer-Based Radiomics Models
    • 摘要
    • 方法
    • 实验结果

STAR-Echo: A Novel Biomarker for Prognosis of MACE in Chronic Kidney Disease Patients Using Spatiotemporal Analysis and Transformer-Based Radiomics Models

摘要

慢性肾脏病(CKD)患者患有主要不良心血管事件(MACE)的风险较高。超声心动图评估左心室(LV)功能和心脏异常。LV壁(LVW)的病理生理学和收缩期/舒张期功能与CKD患者的MACE结果(O-和O+)相关联。然而,传统的基于LV容积的测量,如射血分数,其预测价值有限,因为它们仅依赖于末期帧。

我们假设通过时空分析,对比分析LVW的形态可以预测CKD患者的MACE风险。然而,由于噪声、分辨率低和需要手动干预,准确地描绘和分析每个帧的LVW是具有挑战性的。

本文包括:
(a)开发一个自动化流水线,用于识别和标准化心跳周期,并分割LVW;
(b)引入一个新颖的计算生物标志物—STAR-Echo—它结合了来自放射组学(MR)和深度学习(MT)模型的时空风险,用于预测CKD患者的MACE预后;
(c)证明了与MR、MT以及临床生物标志物(EF、BNP和NT-proBNP)相比,STAR-Echo具有更优越的预后性能,用于表征心脏功能障碍。STAR-Echo捕获了LVW的灰度级分布、周长和球度,这些在遭受MACE结果的个体中随时间变化不同。

STAR-Echo在MACE结果分类方面实现了0.71 [0.53−0.89]的AUC,并在一个CKD患者的保留队列(Sv = 44,N = 150)上展示了在Kaplan-Meier生存分析中的预测能力。与MR(p值=0.042)、MT(p值=0.069)和临床生物标志物—EF、BNP和NT-proBNP(p值>0.05)相比,它实现了更优越的MACE预测能力(p值=0.037(对数秩检验))
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方法

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Fig. 1. 时空分析和STAR-Echo的工作流程:STAR-Echo将来自时空模型MR和MT的互补预测进行融合。输入的超声视频经过预处理,以识别在2个舒张末期(ED)帧之间的心跳周期。所有超声视频都被标准化为30帧。分割和蒙版的LVW视频被输入到MR和MT管道中。

实验结果

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