靶点专题
2024-AIDD-人工智能药物设计-利用深度学习优化中药复方益气解毒方对胶质母细胞瘤靶点的药物设计研究
利用深度学习优化中药复方益气解毒方对胶质母细胞瘤靶点的药物设计研究 1. 引言 1.1 研究背景与意义 1.1.1 胶质母细胞瘤的治疗现状 1.1.1.1 胶质母细胞瘤的流行病学 1.1.1.1.1 全球与地区发病率对比 1.1.1.1.2 年龄与性别分布统计 1.1.1.2 传统治疗手段的局限性 1.1.1.2.1 手术治疗的限制与挑战 1.1.1.2.2 化疗与放疗的副作用分
2024-AIDD-人工智能药物设计-基于深度学习的胶质母细胞瘤靶点蛋白的识别与药物设计
UniProt搜索胶质母细胞瘤相关蛋白：从UniProt数据库查找胶质母细胞瘤相关的蛋白质数据是一个很好的开始，这可以帮助你识别与疾病相关的关键蛋白。 疾病与中药交集分析：研究中药（如益气解毒方）与胶质母细胞瘤的关系，结合西药及其他数据库如GeneCards的数据，这有助于揭示潜在的治疗机制或药物靶标。 调控网络分析：通过分析调控网络，可以了解哪些转录因子、信号通路在胶质母细胞瘤中扮演重要角
DrugBAN：基于双线性注意力网络进行药物-靶点结合预测。
DrugBan：一种可解释的双线性注意力网络进行药物-靶点结合预测。 提示：写完文章后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录 DrugBan：一种可解释的双线性注意力网络进行药物-靶点结合预测。前言一、模型框架1. 编码器2. 双线性注意力网络（BAN）3. 对抗性的领域适应网络（CDAN） 二、结果1. 模型性能2. 消融实验3. 模型解释性 总结
药物靶点项目常见FAQ
1 我想做一个药物的靶点筛选，你们能做嘛？ 您这边药物是什么类型的呢？如果是小分子化合物的话，是可以的，可以用我们公司的人类蛋白芯片去筛选直接靶点。也可以用 pull-down+MS 的手段去钓靶点，但是这两种实验都是要在小分子化合物上生物素的。您这边小分子有生物素修饰嘛？ 2 小分子有推荐的标记方案吗？ 我们可能更推荐可以改善水溶性的方案，因为大部分的小分子水溶性都不太好，而我们后面芯片实
BioTech - 药物靶点识别框架
欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/135247719 药物的靶点识别是指通过生物信息学、化学信息学、分子生物学等方法，从大量的候选靶点中筛选出与某一疾病相关的有效靶点，从而为药物设计提供依据。药物的靶点识别是药物发现过程中的重要步骤，决定了药物的作
Nature：激酶正成为炎症和自身免疫病的热门靶点（二）| 鹰谷靶点
续 之前小编给大家分享了文章的总论和部分各论《Nature：激酶正成为炎症和自身免疫病热门靶点（一）| 鹰谷靶点》，下面把剩下的各论也抛砖引玉地分享给大家。 ITK和BTK TEC家族是表达在胞内的非受体蛋白酪氨酸激酶，家族成员有BTK、ITK/TSK/EMT、TEC、TXK和BMX，其结构具有高度同源性。TEC激酶家族主要在造血细胞中表达，在白细胞的发育和功能中具有重要的作用。其中，BT
Nature：激酶正成为炎症和自身免疫病的热门靶点（一）| 鹰谷靶点
引言 第一个激酶抑制剂——伊马替尼（格列卫）的发现标志着靶向激酶治疗肿瘤的开始，至今已有20年的历史。免疫性疾病早期的治疗以小分子抗炎药物、抗体药物和免疫抑制为主，但通常治疗效果不佳或患者不能耐受。近些年来，由于免疫性疾病的机制不断被发现，激酶在其中的作用越来越受到大家的关注。免疫性疾病的发病机制复杂，且发病率呈现逐年上升趋势。尽管最近自身免疫病和炎症疾病的治疗取得了很大进展，但仍存在很多未得
KARS研究新热潮：靶点突变蛋白和野生蛋白研究
Ras蛋白是一类大小为21kD左右的单体三磷酸鸟苷（GTP）结合蛋白，为原癌基因RAS的表达产物，其存在于人类的大部分细胞中，能够结合GTP并且具有较弱的GTP水解酶活性。RAS基因突变是zui常见的人类致癌基因突变之一。RAS基因家族有三个成员，KRAS、NRAS、HRAS，其中KRASzui为常见，是肺癌、胰腺癌、结肠癌等实体肿瘤中常见的致癌基因。 KRAS4A和KRAS4B是KRAS基因的
劳拉替尼：克唑替尼耐药后ALK和ROS1靶点肺癌治疗的新星
（图片来源于网络） 劳拉替尼（Lorlatinib）是辉瑞公司开发的一种新型、可逆、强效小分子ALK和ROS1抑制剂，其对ALK已知的耐药突变均具有很强的抑制作用，因而被誉为第3代ALK抑制剂。这款三代靶向药物的强大之处在于可以克服所有已知的ALK抗性突变并可通过血脑屏障；可抑制克唑替尼耐药的9种突变，对二代TKI药物耐药后仍有较高的有效性；同时劳拉替尼也具有较强的血脑屏障透过能力，入脑效果较强
塞尔帕替尼的靶点以及疗效【医游记】
（图片来源于网络） 塞尔帕替尼（Selpercatinib）是一种高选择性和抑制活性的小分子RET（受体酪氨酸激酶）抑制剂。它是全球首个获批的高选择性RET抑制剂，用于治疗RET融合阳性的转移性非小细胞肺癌的成年患者、需要系统性治疗的携带RET突变的晚期或转移性甲状腺髓样癌成人和12岁及以上的儿童患者以及需要系统性治疗和放射性碘治疗（如适用）难治的RET融合阳性的晚期或转移性甲状腺癌成人和1
8+双疾病+WGCNA+多机器学习筛选疾病的共同靶点并验证表达
今天给同学们分享一篇双疾病+WGCNA+多机器学习的生信文章“Shared diagnostic genes and potential mechanism between PCOS and recurrent implantation failure revealed by integrated transcriptomic analysis and machine learning”，这篇
8+双疾病+WGCNA+多机器学习筛选疾病的共同靶点并验证表达
今天给同学们分享一篇双疾病+WGCNA+多机器学习的生信文章“Shared diagnostic genes and potential mechanism between PCOS and recurrent implantation failure revealed by integrated transcriptomic analysis and machine learning”，这篇
CADD课程学习（3）-- 靶点药物相互作用(PyMol)
CADD课程学习（3）-- 靶点药物相互作用 PyMol软件教程 基本操作 任意旋转图像：对准图像的任意处点住鼠标左键然后移动鼠标 放大/缩小图像：对准图像的任意处点住鼠标右键然后移动鼠标（向上是缩小，向下则是放大） 移动图像：对准图像的任意处点住鼠标中键或者滚轮，然后移动鼠标命令行输入：fetch 1lEP 从PDB数据库网站下载晶体结构1lEP，在pymol打开 Step1：
鹰谷靶点 | 动物实验疗效显著，TMUB1可能成为PD-L1通路的潜在免疫治疗新靶点 | Nature子刊
我们都知道，肿瘤细胞的“精明”之处在于它可以通过免疫编辑来规避免疫识别，从而逃避免疫系统的攻击。免疫编辑涉及免疫检查点分子的调节，如程序化细胞死亡配体-1（PD-L1）。表达在T细胞上的PD-1与肿瘤细胞上的PD-L1之间的相互作用抑制CD8+T细胞的激活和扩张，使癌细胞能够逃避免疫破坏[1,2]。 针对PD-L1/PD-1轴的检查点阻断疗法已显示出临床疗效[3]。然而，大多数患者对这些治疗反
人类蛋白质组芯片助力药物靶点筛选
As2O3这一古老的中药在急性早幼粒细胞白血病（APL）治疗中的作用明确，并且对其它恶性肿瘤也具有显著治疗效果。As2O3直接作用靶点的鉴定是揭开其作用机理的最关键一环，然而该科学问题一直困绕着药学研究领域的专家学者们，本次解读分享，华盈生物合作伙伴上海交通大学陶生策教授课题组研究人员，应用高通量的人类蛋白质组芯片技术找到了360个特异性的砒霜（As2O3）结合蛋白。该研究揭示了As2O3通过抑制
学术速运|MFR-DTA：一个预测药物-靶点结合亲和力和区域的多功能模型
题目：MFR-DTA: A Multi-Functional and Robust Model for Predicting Drug-Target Binding Affinity and Region 文献来源: DOI: 10.1093/bioinformatics/btad056 代码：https://github.com/JU-HuaY/MFR 简介：近年来，深度学习已经成为药