异质性专题

Nature Microbiology丨VITA单细菌转录组测序技术助力深入解析奶牛瘤胃微生物组功能异质性

瘤胃微生物组一直以来都是研究相对不足但又极其复杂的微生物生态系统之一。瘤胃微生物能够有效降解植物纤维,将其转化为高质量的蛋白质产品,在这一过程中,由于微生物强烈的发酵,还会产生大量气体,其成分主要包括二氧化碳和甲烷等温室气体,还有少量的氮气和微量的氢气、氧气和硫化氢,这些排放的温室气体甚至会对全球环境造成较大的影响。近些年以来,在宏组学技术的推动下,对瘤胃微生态系统功能的认识已取得了显著进展。然而

成功案例|全基因组测序+GWAS联合分析揭示不同种族帕金森病的遗传同质性和异质性

发表期刊:npj Parkinson’s Disease 影响因子:8.7 测序方式:WGS 研究对象:人 1   研究背景 帕金森病(PD)是一种常见的与年龄相关的神经退行性疾病,其特征是运动迟缓、姿势不稳定、僵硬和静息性震颤。临床表现包括非运动症状,如认知功能障碍、自主神经功能障碍、睡眠障碍、抑郁和睡眠功能减退。在中国,到2030年,PD患者的人数预计将达到494万人,占

肿瘤微环境异质性对治疗反应的影响(综述)

Influence of tumour micro-environment heterogeneity on therapeutic response | Nature 肿瘤的形成涉及肿瘤细胞与细胞外基质、肿瘤血管和免疫细胞的共同进化。肿瘤的成功生长和最终转移并不完全取决于肿瘤细胞的基因改变,还取决于这种突变在特定环境中带来的适应性优势。由于适应性取决于环境,因此将肿瘤作为完整的器官,而不仅仅是

阿趣课堂丨一作解读(IF 31.373) 三阴性乳腺癌铁死亡异质性的揭示

三阴性乳腺癌 三阴性乳腺癌(Triple-negative breast cancer, TNBC)是临床上一种异质性疾病,约占确诊乳腺癌的15%。因异质性高、预后差、复发转移风险高等特点,成为乳腺癌研究中亟需攻克的顽固“堡垒”。2019年邵志敏/江一舟团队根据分子特征、代谢重编程和肿瘤微环境方面的异质性提出三阴乳腺癌的“复旦分型”,随后又针对不同亚型进行了系列精准治疗临床试验。与传统化疗相比,

尺度、空间异质性、干扰、景观多样性、景观连接度,对其概念的理解

目录 1. 尺度 1.1尺度概念 1.2.尺度的表达 1.3.尺度的基本类型 1.4. 尺度的等级 1.5. 尺度推绎 2.干扰 2.1干扰概述 2.2干扰的概念 2.3干扰的类型 2.4人类干扰对土地利用变化影响: 2.5.干扰与景观异质性、景观多样性等关系 2.6干扰的生态意义和社会意义 3. 空间异质性 (一)非生物环境的空间异质性 (二)植物空间异质性 4

因果推断《Causal Inference in Python》中文笔记第6章 效果异质性

《Causal Inference in Python: Applying Causal Inference in the Tech Industry》因果推断啃书系列   第1章 因果推断导论   第2章 随机实验与统计学回顾   第3章 图形化因果模型   第4章 线性回归的不合理有效性   第5章 倾向分   第6章 效果异质性   第7章 元学习器   第8章 双重差分

文献阅读003:单细胞肿瘤浸润性髓系细胞的异质性(综述)

![生信交流与合作请关注公众号@生信探索] 综述主要介绍了Mast、Dendritic、Monocyte、Macrophage、Neutrophils细胞,其中Neutrophils不是很详细,因此只总结了前4中细胞的亚群marker和特征。以思维导图形式总结在幕布,方便以后增删改查。 幕布文档链接: https://www.mubucm.com/doc/7V2nk7N6B_1 密码: 9adx

meta分析的异质性检验指标如何计算?

一、什么是异质性? 广义:描述参与者、干预措施和一系列研究间测量结果的差异和多样性,或那些研究中内在真实性的变异。 狭义:统计学异质性,用来描述一系列研究中效应量的变异程度,也用于表明除仅可预见的偶然机会外研究间存在的超逸。 二、异质性分析怎么做? (1)异质性检验 可以使用异质性检验进行异质性分析,结论更加客观,其中包括:Q检验,I2值判断,H值判断等。通常情况下Q检验时p 值

R语言对混合分布中的不可观测与可观测异质性因子分析

最近我们被客户要求撰写关于利率制定的研究报告,包括一些图形和统计输出。 今天上午,在课程中,我们讨论了利率制定中可观察和不可观察异质性之间的区别(从经济角度出发)。为了说明这一点,我们看了以下简单示例。让  X 代表一个人的身高。考虑以下数据集 > Davis[12,c(2,3)]=Davis[12,c(3,2)]  在这里,关注变量是给定人的身高, > X=Davis$heigh

GWR与ARCGIS共同分析空间异质性

实验目的与意义 了解MGWR软件并对老师所给数据利用MGWR分析分析得到的excel数据导入arcgis进行空间分析回归系数图以及空间分布图 二、实验内容 1.了解MGWR软件的基本功能,根据老师说给的实验数据进行分析。导入数据,变量,存储文档等功能,填写好各种参数就可以RUN! 2.run完得到分析好的excel,再通过表格筛选需要的数据,利用if(p<0.05,beta,0)

R语言地理加权回归、主成份分析、判别分析等空间异质性数据分析

在自然和社会科学领域有大量与地理或空间有关的数据,这一类数据一般具有严重的空间异质性,而通常的统计学方法并不能处理空间异质性,因而对此类型的数据无能为力。以地理加权回归为基础的一系列方法:经典地理加权回归,半参数地理加权回归、多尺度地理加权回归、地理加权主成份分析、地理加权判别分析是处理这类数据的有效模型。本次培训从局部加权回归开始,详细讲述了基于R语言的空间异质性数据分析方法。

易基因:单细胞转录组测序(scRNA-seq)揭示猪窦卵泡细胞异质性和通讯模式|项目文章

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 卵母细胞是哺乳动物生命的基础,它们在卵巢中的卵泡小囊中发育,卵母细胞发育的最后阶段发生在窦状卵泡(Antral Follicles)中。卵母细胞的成功生长和成熟取决于与邻近细胞(主要是颗粒细胞)的复杂互作。了解窦卵泡内这些颗粒细胞之间的差异以及如何双向通讯,对于了解哺乳动物如何繁殖和生长至关重要。 先前研究鉴定出窦卵泡中颗粒细胞的