ggplot2专题

ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源 ggplot2学习笔记之图形排列 R包ggseqlogo |绘制序列分析图编者按：数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功底，能否达意是最基本的要求---最合适的图示和配色表达最直观的含义。长文多图预警，这是关于ggplot2使用的极详细教程（190+图），是入门和晋级

R语言可视化入门——使用ggplot2将模拟结果可视化

目录零、引言一、数据生成二、单参数的展示（不同方法和案例）三、双参数的展示（不同方法和案例）四、后期服务零、引言在做科研时候，往往会设计不同的案例，不同参数和不同方法来说明自己模型（方法）的可行性。但是如何将这些元素展现在一张图上就至关重要，本文主要介绍了不同案例不同方法参数下基于ggplot2系统的可视化。具体细节没有细致的讲解，感兴趣的可以自行学习。一、数据生成

shiny + bootstrap + shinythemes + ggplot2 + sunburst 动态交互式可视化web框架搭建

利用shiny + bootstrap + shinythemes + ggplot2 + sunburst 搭建自己的交互式可视化web

ggplot2又添新神器——ggthemr助你制作惊艳美图

今天在浏览ggplot扩展插件目录的时候，又发现了一款神器——ggthemr。这是继ggplot2的ggtheme包、RColorBrewer包之后(不算ggtech和ggsci这两个小众包)第三款ggplot配色神器。既然是神器，那肯定功能超级强大喽，下面就讲讲它强大在哪儿~ 这个包里面提供了将近20宽完善的配色和主题风格模板。每一个模板都拥有完善的标度和主题设定(包括离散标度和连续标

ggplot2包介绍学习

分析数据要做的第一件事情，就是观察它。对于每个变量，哪些值是最常见的？值域是大是小？是否有异常观测？ ggplot2图形之基本语法： ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离ggplot2是按图层作图ggplot2保有命令式作图的调整函数，使其更具灵活性ggplot2将常见的统计变换融入到了绘图中。ggplot的绘图有以下几个特点：第一，有明确的起始（以gg

如何用R语言ggplot2画高水平期刊散点图

文章目录前言一、数据集二、ggplot2画图1、全部代码2、细节拆分1）导包2）创建图形对象3）主题设置4）轴设置5）图例设置6）散点颜色7）保存图片前言一、数据集数据下载链接见文章顶部处理前的数据： library(readxl)library(reshape2) # reshape2 包是 R 语言中的一个数据处理包，主要用于数据重

如何用R语言ggplot2画折线图

文章目录前言一、数据集二、ggplot2画图1、全部代码2、细节拆分1）导包2）创建图形对象3）主题设置4）轴设置5）图例设置6）颜色7）保存图片前言一、数据集数据下载链接见文章顶部数据： library(readxl)data <- read_excel("fig3_line.xlsx", sheet = "Sheet1") 二、g

探索ggh4x包：使用ggplot2扩展包创建多功能图形

简介 ggh4x包是一个ggplot2扩展包。它提供了一些实用函数，这些函数并不完全符合“图形语法”概念——它们可能有点hacky——但仍然可以在调整ggplots时非常有用。例如，调整facet的大小、将多个美学映射到颜色以及为facet指定单独的比例尺。此外，它还是一小部分几何对象geoms、facets、位置positions、指南guides和统计信息stats。 librar

R语言入门 | 使用 ggplot2 进行数据可视化

1.0准备工作先下好tidyverse包，并进行加载。 install.packages ( "tidyverse" ) library(tidyverse) R 包只需安装一次，但每次开始新会话时都要重新加载。 1.1 数据框数据框是变量（列）和观测（行）的矩形集合。下文经常使用mpg 包含了由美

R语言ggplot2包绘制散点图详解

List item R语言的ggplot包可以实现各种复杂的制图功能，本文以散点图为例，介绍ggplot2代码的使用方法。首先，使用R内置数据attitude绘制complaints和learning的散点图。请注意ggplot2语法和R原生代码的区别。ggplot2采用图层模式，不同图层用“+”叠加。 > head(attitude,3)rating complaints privileg

科研学习|可视化——ggplot2版本的网络可视化

ggplot2是R语言中一个非常流行的数据可视化包，它也可以用于网络可视化。以下是三个基于ggplot2并专门用于网络可视化的R包： ggnet2: 这个包的使用方法与传统的plot函数相似，易于使用。更多信息可在其官方页面查看：ggnet2 geomnet: 这个包在ggplot2中增加了geom_net层，可以使用数据框作为输入，并且可以与Plotly交互，从而支持交互式图形。有关更多信

基于R的ggplot2包画KEGG富集通路气泡图_KEGGdot

背景** 基于公司已给出的结果上做出调整（公司只给出了top10），画KEGG富集通路的气泡图，初始文件如下图代码演示 > getwd() #显示工作目录> setwd() #如果上述显示不是想要的路径，可以新建一个文件夹然后设置成工作目录，方便一些原始文件以及结果图片的存放> install.packages("ggplot2",destdir="D:/RData/R-win-4.

R version 4.1.0 安装ggplot2，options(pkgType=“binary“) install.packages(“ggplot2“)

R version 4.1.0 安装ggplot2 R version 4.1.0 安装ggplot21. 报错信息2. 成功安装3. 参考资料 R version 4.1.0 安装ggplot2 # 直接安装报错install.packages("ggplot2")# 安装成功options(pkgType="binary")install.packages("ggpl

第五章，数据可视化-ggplot2

简介虽然，目前有很多工具可以用来进行数据分析，但是R语言在数据可视化上的优势基本无它能敌。其中最具盛名的包就是Hadly Wickham开发的ggplot2包。正文一，快速探索数据-从qplot开始 R中查看函数文档信息 require(ggplot2)help("qplot")qplot(x, y, ..., data, facets = NULL, margins = F

ggplot2 保存图片字体不协调

在使用R语言ggplot2 package画图时，导出图片总会遇到标题字体与图片不协调的情况，下面提出一种解决方案 library(Cairo)library(ggplot2)p <- ggplot(mtcars, aes(factor(cyl)))# By default, uses stat="bin", which gives the count in each categoryp

ggplot2 左右两个y轴

z两个ggplot 图合并到一起，一个x轴两个y轴 raw_data <- read_delim('./data/GO_pathway.txt', delim = '\t')head(raw_data)library(dplyr)library(Cairo)double_y_axis <- function(p1, p2){g1 <- ggplot_gtable(ggplot_build(

ggplot2 学习

theme(axis.text.x=element_text(angle=90, size=8, vjust=0.8)) 旋转x轴标题 theme(plot.margin = unit(c(0.1, 0, 0, 0),"cm")) 为图片设置margin，顺序遵循上右下左 library(gridExtra)grid.arrange(g1, g2, g3, g4, main, sub

ggplot2组合绘制多个图形

win.graph()library(ggplot2)library(cowplot)library(showtext)font_add_google("Dancing Script", "Dancing") 图1 plot.iris <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +geom_point() +facet_grid

R语言中ggplot2图例位置、颜色、背景、标题

目录 1、不显示图例 2、自定义图例位置 3、修改图例背景颜色、外框颜色、大小 4、修改图例大小 5、图例设置背景、线框为空 6、自定义设置多个图例的标题 7、设置多个图例的之间的间隔 8、取消不需要的图例显示 1、不显示图例 theme(legend.position = "none") 引号内可选参数有right、left、bottom，对应右、下、左 2、自定

[R] ggplot2 - exercise (“fill =“)

We have made the plots like: Let's practice with what we have learnt in: [R] How to communicate with your data? - ggplot2-CSDN博客https://blog.csdn.net/m0_74331272/article/details/136513694 #tut

R语言可视化 ggplot2—设定、映射、分组、匹配图形属性和图形对象

设定、映射、分组、匹配图形属性和图形对象设定和映射分组多个分组与单个图形属性不同图层上的不同分组给Oxboys数据添加光滑曲线(`smooth`) 修改默认分组(`group`) 匹配图形属性和图形对象用线性插值法做颜色渐变线条fill构造叠加条形图设定和映射除了可以将一个图形属性映射到一个变量，你也可以在图层的参数里将其设定为一个单一值（例如，colour="red"）

ggplot2的简单实用

ggplot2的简单实用本文参考了《ggplot2作图详解》http://www.plob.org/2014/01/24/7452.html, 这篇文章比较详细介绍ggplot2的绘图过程，本文只是一个简单使用的总结，能满足数据分析过程的大部分图标要求。 ggplot2包有两个绘图方法，一个是qplot，一个是ggplot方法。 qplot()函数即 quick plot(快速绘图),是R

[R语言]ggplot2画图保存方法

##方法一ggsave(filename, plot = last_plot(), device = NULL, path = NULL,scale = 1, width = NA, height = NA, units =c("in", "cm", "mm"),dpi = 300, limitsize = TRUE, ...)##方法二p <- ggplot(...) + ...pdf('

【转载】ggplot2主题设置

原文摘自http://www.rpubs.com/lihaoyi/156592 library(ggplot2) #加载ggplot2包library(gcookbook) #加载本书的数据包主题theme参数设置改变字体类型、大小，图例、坐标轴、背景等各种元素，可通过theme()函数来完成 library(ggplot2)library(grid) #为了使用un

ggplot2设置坐标轴范围_9.2 分面：各分面使用自己的坐标轴刻度范围

参考自《R Graphics Cookbook》当在ggplot2中使用分面时，不管是垂直还是水分分面，其坐标轴范围默认所以分面都是相同的。这样可能由于不同的行、列分面间的数据的范围不尽相同，而最后产生不适当的表达。因此，本节内容：让不同行、列的分面使用更合适自己的坐标轴刻度范围。 library(ggplot2) #底图 mpg_plot <- ggplot(mpg, aes(x = di

ggplot2：云雨图

准备工作加载使用的包 library(tidyverse)library(gghalves) 数据集这里我们使用 iris 这个数据集，先看一下数据集的格式 iris 是R 语言中自带的数据集，可以在R中输入 data() 查看所有数据集 head(iris) 从变量的角度来说，该数据集有两个重复测量变量(被试内变量)，一个被试间变量，目前的数据结构是无法直接使用