成功案例(IF=7.3)| 转录组+蛋白质组+代谢组联合分析分析揭示胰腺癌中TAM2相关的糖酵解和丙酮酸代谢重构

本文主要是介绍成功案例(IF=7.3)| 转录组+蛋白质组+代谢组联合分析分析揭示胰腺癌中TAM2相关的糖酵解和丙酮酸代谢重构,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

图片

研究背景

肿瘤的进展和发展需要癌细胞的代谢重编程,癌细胞能量代谢模式的改变可以满足快速增殖和适应肿瘤微环境的需要。肿瘤微环境(TME)中的代谢状态受到多种因素的影响,包括血管生成、与其他细胞的相互作用和系统代谢。代谢异质性可影响治疗效果,并可能预测临床结果。然而,很少有研究关注基于代谢异质性来区分亚型的方法。

胰腺癌(PAAD)是一种预后不良、死亡率高的恶性肿瘤。肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的大量浸润是PAAD的一个显著特征。TAMs可与胰腺癌细胞相互作用,调节代谢、炎症和免疫状态,形成免疫抑制TME,最终促进肿瘤的发生和发展。研究表明,巨噬细胞会影响胰腺癌细胞的生物学功能,如葡萄糖代谢。然而,目前仍缺乏一种结合TAM和代谢相关特征来识别PAAD新分子亚型的方法。代谢亚型为新一代癌症治疗的患者分类提供了一个独特的视角,因此,根据免疫代谢特性开发新的分子亚型对提高精准医疗至关重要。

本研究中,作者根据多组学方法将PAAD分为4个具有不同免疫代谢特征的代谢亚型,并探讨了检测到的代谢亚型在PAAD的临床特征、预后和治疗中的作用,旨在为PAAD的免疫治疗提供新的认识。

研究思路

图片

研究结论

在本研究中,作者基于多组学分析策略,将PAAD样本分为具有不同代谢特征的分子亚型。收集20个PAAD组织和10个正常胰腺组织用于蛋白质组学和代谢组学分析。来自TCGA-PAAD队列的RNA测序数据用于转录组学分析。采用免疫组化方法评估PAAD组织中TAM2的浸润情况。转录组学和免疫组化结果显示,PAAD中TAM2浸润水平上调,并与患者预后不良相关。蛋白质组学和代谢组学结果表明,PAAD中多种代谢过程被异常调控,这种失调与TAM2浸润水平有关。WGCNA证实了丙酮酸和糖酵解/糖异生是TAM2在PAAD中共同表达的代谢途径。基于转录组数据,作者将PAAD样本分为4种与TAM2相关的代谢亚型。代谢亚型各具有临床预后、肿瘤微环境、免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和功能机制等特征。该研究证实了PAAD中丙酮酸的代谢重构和糖酵解/糖异生与TAM2密切相关,且基于TAM2相关代谢通路的分子亚型为PAAD患者的预后预测和治疗提供了新的见解。

这篇关于成功案例(IF=7.3)| 转录组+蛋白质组+代谢组联合分析分析揭示胰腺癌中TAM2相关的糖酵解和丙酮酸代谢重构的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/968066

相关文章

Go标准库常见错误分析和解决办法

《Go标准库常见错误分析和解决办法》Go语言的标准库为开发者提供了丰富且高效的工具,涵盖了从网络编程到文件操作等各个方面,然而,标准库虽好,使用不当却可能适得其反,正所谓工欲善其事,必先利其器,本文将... 目录1. 使用了错误的time.Duration2. time.After导致的内存泄漏3. jsO

springboot循环依赖问题案例代码及解决办法

《springboot循环依赖问题案例代码及解决办法》在SpringBoot中,如果两个或多个Bean之间存在循环依赖(即BeanA依赖BeanB,而BeanB又依赖BeanA),会导致Spring的... 目录1. 什么是循环依赖?2. 循环依赖的场景案例3. 解决循环依赖的常见方法方法 1:使用 @La

Spring事务中@Transactional注解不生效的原因分析与解决

《Spring事务中@Transactional注解不生效的原因分析与解决》在Spring框架中,@Transactional注解是管理数据库事务的核心方式,本文将深入分析事务自调用的底层原理,解释为... 目录1. 引言2. 事务自调用问题重现2.1 示例代码2.2 问题现象3. 为什么事务自调用会失效3

找不到Anaconda prompt终端的原因分析及解决方案

《找不到Anacondaprompt终端的原因分析及解决方案》因为anaconda还没有初始化,在安装anaconda的过程中,有一行是否要添加anaconda到菜单目录中,由于没有勾选,导致没有菜... 目录问题原因问http://www.chinasem.cn题解决安装了 Anaconda 却找不到 An

Spring定时任务只执行一次的原因分析与解决方案

《Spring定时任务只执行一次的原因分析与解决方案》在使用Spring的@Scheduled定时任务时,你是否遇到过任务只执行一次,后续不再触发的情况?这种情况可能由多种原因导致,如未启用调度、线程... 目录1. 问题背景2. Spring定时任务的基本用法3. 为什么定时任务只执行一次?3.1 未启用

JavaScript Array.from及其相关用法详解(示例演示)

《JavaScriptArray.from及其相关用法详解(示例演示)》Array.from方法是ES6引入的一个静态方法,用于从类数组对象或可迭代对象创建一个新的数组实例,本文将详细介绍Array... 目录一、Array.from 方法概述1. 方法介绍2. 示例演示二、结合实际场景的使用1. 初始化二

C++ 各种map特点对比分析

《C++各种map特点对比分析》文章比较了C++中不同类型的map(如std::map,std::unordered_map,std::multimap,std::unordered_multima... 目录特点比较C++ 示例代码 ​​​​​​代码解释特点比较1. std::map底层实现:基于红黑

Spring、Spring Boot、Spring Cloud 的区别与联系分析

《Spring、SpringBoot、SpringCloud的区别与联系分析》Spring、SpringBoot和SpringCloud是Java开发中常用的框架,分别针对企业级应用开发、快速开... 目录1. Spring 框架2. Spring Boot3. Spring Cloud总结1. Sprin

Spring 中 BeanFactoryPostProcessor 的作用和示例源码分析

《Spring中BeanFactoryPostProcessor的作用和示例源码分析》Spring的BeanFactoryPostProcessor是容器初始化的扩展接口,允许在Bean实例化前... 目录一、概览1. 核心定位2. 核心功能详解3. 关键特性二、Spring 内置的 BeanFactory

MySQL中实现多表查询的操作方法(配sql+实操图+案例巩固 通俗易懂版)

《MySQL中实现多表查询的操作方法(配sql+实操图+案例巩固通俗易懂版)》本文主要讲解了MySQL中的多表查询,包括子查询、笛卡尔积、自连接、多表查询的实现方法以及多列子查询等,通过实际例子和操... 目录复合查询1. 回顾查询基本操作group by 分组having1. 显示部门号为10的部门名,员