蛋白专题

西湖大学卢培龙团队突破：精确从头设计异手性蛋白复合物，开启镜像蛋白研究新篇章

在生物科学的浩瀚星空中，蛋白质作为生命活动的基本承担者，其设计与合成一直是科学家们不懈探索的领域。近日，西湖大学卢培龙团队携手清华大学刘磊团队，在《Cell Research》期刊上发表了一项革命性的研究成果——首次实现了异手性蛋白复合物的精确从头设计，这一突破不仅填补了蛋白质设计领域的一大空白，更为分子工具、疾病治疗及诊断技术的发展开辟了新的可能性。异手性蛋白：生命科学的神秘探索蛋白质是

PUREfrex® — 重组无细胞蛋白合成系统

PUREfrex® ——重组无细胞蛋白合成系统 PUREfrex®是一种基于PURE系统技术新开发的体外转录/翻译偶联系统，与S30体外翻译系统不同，PUREfrex®是重组无细胞蛋白合成系统，反应系统由蛋白质、核糖体、氨基酸和NTPs组成。只需将编码感兴趣蛋白质的DNA(或mRNA)与试剂盒中溶液I、II和III混合，37℃孵育反应数小时，即可完成蛋白质合成。构成PUREfrex®试剂盒的蛋

如何快速从基因组中提取基因、转录本、蛋白、启动子、非编码序列？

有读者留言想要提取外显子，内含子，启动子，基因体，非编码区，编码区，TSS上游1500,TSS下游500的序列。下面我们就来示范如何提取这些序列。 NGS基础 - 参考基因组和基因注释文件提到了如何下载对应的基因组序列和基因注释文件。假如我们已经拿到了基因组序列文件GRCh38.fa和基因注释文件GRCh38.gtf，也可从文后链接获取。查看下文件内容和格式基因组序列文件为FASTA

免费生物蛋白质的类chatgpt工具助手copilot：小分子、蛋白的折叠、对接

参考： https://310.ai/copilot 可以通过自然语言通话晚上蛋白质的相关处理：生成序列、折叠等应该是agent技术调用不同工具实现从UniProt数据库中搜索和加载蛋白质。使用ESM Fold方法折叠蛋白质。使用310.ai基础模型设计新蛋白质。使用TM-Align方法比较蛋白质。利用ProteinMPNN模型进行蛋白质逆折叠。聚焦并可视化蛋白质结构的特定部分。生成报

重组蛋白表达系统优缺点对比|卡梅德生物

重组蛋白是现代生物技术中不可或缺的一部分，它们广泛应用于药物开发、研究工具和工业酶的生产。根据目标蛋白的特性和所需的修饰，可以选择不同的表达系统。下文罗列一下四个主要蛋白表达系统的优缺点： 1. 原核表达系统（如大肠杆菌）优点：快速生长：大肠杆菌的增殖速度快，可以在短时间内获得大量的目标蛋白。成本低廉：培养和维护成本较低，适合大规模生产。遗传操作简单：易于操纵的遗传背景，方便进行基因

重组蛋白表达中的质粒构建流程-卡梅德生物

我们在进行重组蛋白表达服务时，首先要根据序列特点合成基因并构建到合适的载体上。重组蛋白表达中的质粒构建是一个复杂但关键的过程，它涉及到将目标基因（即编码所需蛋白质的基因）插入到适当的质粒载体中，以便在后续的实验中能够在宿主细胞内表达该蛋白。以下是质粒构建的基本原理和实验流程：一、原理质粒构建的基本原理是基因工程，即通过人为的方式操作DNA，将其中的特定基因片段（即目标基因）插入到质粒载体中。质

蛋白胨（Peptone）主要应用于微生物发酵领域我国进口量持续增长

蛋白胨（Peptone）主要应用于微生物发酵领域我国进口量持续增长蛋白胨（Peptone）是一种有机化合物，分子式为C5H9NO2。蛋白胨外观呈淡黄至棕黄色粉剂，含有肉香气味，易溶于水，不溶于乙醚、乙醇和氯仿。蛋白胨具有营养程度高、可促进微生物生长、增强机体免疫力等特点，作为微生物发酵重要原材料，在医药、食品加工、保健品等众多领域应用广泛。蛋白胨种类丰富，按照来源不同，

探索纳米抗体免疫原制备的技术难点：蛋白、小分子和多肽的挑战与解决方案-泰克生物

问题1：蛋白质不稳定或难以溶解，以及难以保持其原生态构象答： ①、优化蛋白表达条件：使用适宜的宿主系统：不同的蛋白表达系统（如大肠杆菌、酵母、昆虫细胞或哺乳动物细胞）具有不同的优点，选择最适合目标蛋白的表达系统可以提高其稳定性和溶解性。调整表达条件：改变诱导表达的温度：表达过程中的温度控制会影响蛋白质的溶解度，可通过降低表达温度（例如，从 37°C 改为 18°C）可以促进正确的蛋白质折叠

2024-AIDD-人工智能药物设计-基于深度学习的胶质母细胞瘤靶点蛋白的识别与药物设计

UniProt搜索胶质母细胞瘤相关蛋白：从UniProt数据库查找胶质母细胞瘤相关的蛋白质数据是一个很好的开始，这可以帮助你识别与疾病相关的关键蛋白。疾病与中药交集分析：研究中药（如益气解毒方）与胶质母细胞瘤的关系，结合西药及其他数据库如GeneCards的数据，这有助于揭示潜在的治疗机制或药物靶标。调控网络分析：通过分析调控网络，可以了解哪些转录因子、信号通路在胶质母细胞瘤中扮演重要角

Gromacs软件进行蛋白-配体体系MD模拟

1、进行能量最小化下载官方提供的参数文件：em.mdp ，或者直接复制这里： ; LINES STARTING WITH ';' ARE COMMENTStitle = Minimization ; Title of run; Parameters describing what to do, when to stop and what to saveintegrator

【Schrödinger薛定谔软件使用实战】- 4lyw蛋白实战

文章目录软件选择1 pretein preparation1.1 import and process注意1.1.1 preprocess可能遇到的问题 1.2 review and modify1.3 refine1.3.1 optimize优化氢键网络1.3.2 minimize 氢原子会进行能量最小化 2 ligand prepare3 生成对接盒子-receptor grid g

TransIT-PRO Transfectio 转染试剂专门针对悬浮CHO、悬浮HEK293、蛋白生产

TransIT-PRO Trans fectio转染试剂专门针对悬浮CHO、悬浮HEK293、蛋白生产 Mirus推出的CHOgro®HighYield Expression System（MIR6270）是在CHOgro® Expression System（MIR6260）基础上发展而来，是目前世界上针对CHO悬浮细胞进行瞬时转染并获得高滴度蛋白最先进、最简便高效的工具。与CHOgro®

AI预测小分子与蛋白的相关特征： MegaMolBART, MoFlow，ESM-1, ESM-2

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow 1）MegaMolBART https://github.com/NVIDIA/MegaMolBART 基于 SMILES 的小分子药物发现与化学信息学深度学习模型。 2）MoFlow https://github.com/calvin-zcx/moflow 用flow流方式分子生成 2、蛋白质：ESM-1, ESM-2 https://

高通量蛋白筛选,科研利器—Luminex液相蛋白芯片

1、液相芯片技术的原理液相芯片体系由许多大小均一的圆形微球（直径5.5～5.6 μm）为主要基质构成，每种微球上固定有不同的探针分子，将这些微球悬浮于一个液相体系中，就构成了一个液相芯片系统，利用这个系统可以对同一个样品中的多种不同分子同时进行检测，这种被称之为xMAP的检测技术是1997年由美国Luminex公司开发出来的。

MyBioSource转甲状腺素蛋白定量检测 ELISA试剂盒的应用

转甲状腺素蛋白定量检测试剂盒基本资料：中文名称：转甲状腺素蛋白(transthyretin)ELISA检测试剂盒英文名称：Human Transthyretin (TTR) ELISA Kit cat#：MBS9715973 样本类型：细胞培养上清液、血清、血浆、其他生物液体特点：灵敏性高、特异性强、重复性好转甲状腺素蛋白定量检测 ELISA试剂盒的应用： ELISA法是免疫

MyBioSource转甲状腺素蛋白定量检测试剂盒丨多种属样本检测

转甲状腺素蛋白（transthyretin，TTR）被称为维生素A结合蛋白、前白蛋白（prealbumin，PA）以及甲状腺结合前清蛋白，是一种四聚体结构蛋白，由4个完全相同的亚基通过非共价键结合而成，每个亚基包含了127个氨基酸。TTR在人体内主要有肝脏分泌产生，分布于人体的血浆和脑脊液中，在体内的主要功能是参与甲状腺素和视黄醇的转运，维持体内视黄醇、甲状腺素和视黄醇结合蛋白的正常水平。

MyBioSource多种属样本转甲状腺素蛋白ELISA检测试剂盒方案

艾美捷 MyBioSource 转甲状腺素蛋白（transthyretin，TTR）被称为维生素A结合蛋白、前白蛋白（prealbumin，PA）以及甲状腺结合前清蛋白，是一种四聚体结构蛋白，由4个完全相同的亚基通过非共价键结合而成，每个亚基包含了127个氨基酸。TTR在人体内主要有肝脏分泌产生，分布于人体的血浆和脑脊液中，在体内的主要功能是参与甲状腺素和视黄醇的转运，维持体内视黄醇、甲状腺素和视

Cytoskeleton/艾美捷——微管蛋白tubulin染色、活细胞成像

前面我们介绍过Cytoskeleton在生物学中的研究和贡献，并将之统计，比如氧化Actin，Actin甲硫氨酸氧化、微管蛋白tubulin染色等等。那你真的了解Cytoskeleton吗？Cytoskeleton还有哪些研究呢，接下来将再简单介绍下。 Cytoskeleton是谁？ Cytoskeleton：为药物筛选，信号转导和细胞骨架研究提供广泛的试剂盒及相关科研工具。专注于纯化

Immundiagnostik CRP（C反应蛋白）ELISA分析

C 反应蛋白 (CRP)主要在肝细胞中形成。其合成速率受参与炎症过程的细胞因子的影响。生物半衰期估计为 13-16 小时。健康人血清中CRP浓度低于5mg/l。因此，CRP 血清浓度反映了特别敏感的炎症活动，例如 B.体现在急性发热、肺炎和心肌梗塞。最近的研究描述了炎症反应和心血管疾病（动脉硬化、潜伏性、慢性持续性感染）之间的联系。CRP 高敏感性作为炎症标志物可作为评估心肌梗塞或中风的危

蛋白结构预测模型评价指标

欢迎浏览我的CSND博客！ Blockbuater_drug …点击进入文章目录前言一、蛋白结构预测模型评价指标TM-scorelDDT 二、Alphafold中的评价指标pLDDTpTMPAE 三、AlphaFold-multimer 蛋白结构的评价指标DockQipTM 总结参考资料前言本文汇总了AlphaFold和AlphaFold-multimer等

【读文献】DynamicBind生成式模型预测蛋白配体复合物

published at nature communication (2024.01.24) code link paper link 摘要尽管在预测静态蛋白质结构方面取得了重大进展，但蛋白质的内在动态性，受到配体调节，对于理解蛋白质功能和促进药物发现至关重要。传统的对接方法，常用于研究蛋白质-配体相互作用，通常将蛋白质视为刚性体。虽然分子动力学模拟可以提出适当的蛋白质构象，但由于生物学

应用于蛋白-小分子动态对接的等变几何扩散模型-DynamicBind 评测

DynamicBind是一个用于蛋白和小分子复合体系构象采样及其打分的等变几何扩散网络。 DynamicBind利用等变几何扩散网络平滑蛋白-小分子复合结构的势能面，以便促进蛋白-小分复合物构象的转化，从而实现高效的采样。DynamicBind 可以从未结合的蛋白质结构中准确地生成配体结合的特异性构象，而无需带配体蛋白结构或大量MD采样，俗称柔性对接。与柔性对接不同，DynamicBind对

重组人/小鼠/大鼠BDNF/脑源性神经营养因子,无动物源无载体蛋白

脑源性神经营养因子（Brain-derived neurotrophic factor，BDNF）是神经营养因子家族的一员，主要表达于海马、杏仁核、大脑皮质、下丘脑和小脑，也存在于血小板和循环血浆中。BDNF是一种分子量为27.8kDa的蛋白质，含有247个氨基酸残基，在调节中枢神经系统各区域的突触传递和可塑性方面起着关键作用。此外，BNDF可以作为海马突触传递中记忆相关修饰的长时程增强的调节剂。

重组人/小鼠/大鼠BDNF/脑源性神经营养因子, 无动物源无载体蛋白方案

重组人/小鼠/大鼠 BDNF / 脑源性神经营养因子, 无动物源 & 无载体蛋白背景： BDNF，也称为脑源性神经营养因子，由人类BDNF基因。BDNF是神经营养因子家族成员生长因子，它们是相关的至典型神经生长因子。神经营养因子存在于大脑和外围。这个BDNF的多功能性由它对一系列适应性神经元反应包括长期增强（LTP）、长期抑郁（LTD）、某些形式的短期突触可塑性，以及稳态内源性神经元的调节可激励

艾美捷AAT别藻蓝蛋白普通储备溶液制备方案

艾美捷AAT别藻蓝蛋白 (APC) 是一种从蓝绿藻螺旋藻中分离出来的藻胆蛋白。与其他藻胆蛋白一样，APC 是荧光的，具有J高的吸收率和高量子效率。它是一种可以通过常规蛋白质交联技术轻松与抗体和其他蛋白质连接而不改变其光谱特性的蛋白质。别藻蓝蛋白是主要藻胆蛋白中zui不稳定的，在低浓度（包括进行某些测定的浓度）下容易解离。CL-APC 在 α 和 β 亚基之间发生化学交联，比 APC 稳定得多。交联

艾美捷AAT-2554别藻蓝蛋白应用参考文献

别藻蓝蛋白，是由藻蓝胆素与蛋白质结合而成，其吸收光谱和荧光发射光谱与藻蓝蛋白略有差别。中文名称：别藻蓝蛋白英文名称：allophycocyanin 定　　义：由藻蓝胆素与蛋白质结合而成，其吸收光谱和荧光发射光谱与藻蓝蛋白略有差别。应用学科海洋科技（一级学科），海洋技术（二级学科），海洋生物技术（三级学科）别藻蓝蛋白 (APC) 是一种从蓝绿藻螺旋藻中分离出来的藻胆蛋白。与其他