1、vsearch分析工具介绍：         VSEARCH是一个开源免费的64位，无内存限制的扩增子数据处理分析软件。（点到为止，其他的建议大家参考原文献和网站)         github：GitHub - torognes/vsearch: Versatile open-source tool for microbiome analysis         最新文献：Edgar

整理了之前的QIIME 2 学习总结，挑选了非常基础实用的部分做一个QIIME 2 学习大礼包（没错就是这篇文章）。对基础分析的流程来说内容涵盖非常全。 我觉得很适合当作工具书来使用_(:з)∠)_ 如果有帮到你请给一个赞哦~👍 下载这篇文章的 PDF 版随时查阅：QIIME2扩增子分析流程及常用命令.pdf 以下是正文内容： 必看： QIIME 2 官方论坛（非常有用哦） 使用该

在上期内容中，我们介绍了升级后的扩增子分析结果中的差异分析和环境因子关联分析，今天继续来了解其他的分析内容吧！ 一、随机森林分析 随机森林是机器学习算法的一种，目的是根据已有的数据建立模型，从而实现对数据的分类和对其它指标的预测。如果目标变量是分类变量，随机森林可以进行分类；如果目标变量是连续变量，随机森林可以进行回归预测，此外在建立随机森林模型的过程中，还可以找出能够区分不同组样本间差异的关

一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - Melonnpan 摘要 菌群代谢组学，特别是在人类肠道中的代谢组学，开始提供一条新的途径来鉴定疾病中的功能和破坏的生态。然而，这些数据的成本很高，很难大规模获得，而扩增子或鸟枪法宏基因组测序数据对于成千上万的人群来说是现成的。在这里，描述了一个计算方法，以预测新的微生物群落中潜在的不可观察的代谢产物，给予一个模型上训练的配对代谢组和宏基因组