加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二)

2023-10-27 22:40

本文主要是介绍加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在上期内容中,我们介绍了升级后的扩增子分析结果中的差异分析和环境因子关联分析,今天继续来了解其他的分析内容吧!

一、随机森林分析

随机森林是机器学习算法的一种,目的是根据已有的数据建立模型,从而实现对数据的分类和对其它指标的预测。如果目标变量是分类变量,随机森林可以进行分类;如果目标变量是连续变量,随机森林可以进行回归预测,此外在建立随机森林模型的过程中,还可以找出能够区分不同组样本间差异的关键物种或OTU。

随机森林关键物种贡献度

注意事项:大样本量进行随机森林分析结果更可靠哦

二、功能预测分析

根据已知的微生物基因组数据,对微生物群落进行菌群代谢功能的预测,从而把物种的“身份”和它们的“功能”对应起来。根据菌群代谢功能预测结果,我们一方面能一窥菌群功能谱的概貌,发挥菌群多样性测序性价比高的优势;另一方面也能帮助指导后续的实验设计,更合理地筛选用于后续研究的样本。在凌恩生物结题报告中提供了PICRUSt、Tax4Fun和FAPROTAX三种功能预测分析内容。

功能丰度组间差异展示

功能注释相对丰度堆积冲击图

注意事项:Tax4Fun和FAPROTAX软件只适用于16S rRNA数据

除以上这些分析外,针对医学领域客户专门新增了医学版扩增子结题报告,欢迎继续锁定凌恩生物公众号,我们下期见!

这篇关于加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二)的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/288894

相关文章

Security OAuth2 单点登录流程

单点登录(英语:Single sign-on,缩写为 SSO),又译为单一签入,一种对于许多相互关连,但是又是各自独立的软件系统,提供访问控制的属性。当拥有这项属性时,当用户登录时,就可以获取所有系统的访问权限,不用对每个单一系统都逐一登录。这项功能通常是以轻型目录访问协议(LDAP)来实现,在服务器上会将用户信息存储到LDAP数据库中。相同的,单一注销(single sign-off)就是指

Spring Security基于数据库验证流程详解

Spring Security 校验流程图 相关解释说明(认真看哦) AbstractAuthenticationProcessingFilter 抽象类 /*** 调用 #requiresAuthentication(HttpServletRequest, HttpServletResponse) 决定是否需要进行验证操作。* 如果需要验证,则会调用 #attemptAuthentica

性能分析之MySQL索引实战案例

文章目录 一、前言二、准备三、MySQL索引优化四、MySQL 索引知识回顾五、总结 一、前言 在上一讲性能工具之 JProfiler 简单登录案例分析实战中已经发现SQL没有建立索引问题,本文将一起从代码层去分析为什么没有建立索引? 开源ERP项目地址:https://gitee.com/jishenghua/JSH_ERP 二、准备 打开IDEA找到登录请求资源路径位置

MCU7.keil中build产生的hex文件解读

1.hex文件大致解读 闲来无事,查看了MCU6.用keil新建项目的hex文件 用FlexHex打开 给我的第一印象是:经过软件的解释之后,发现这些数据排列地十分整齐 :02000F0080FE71:03000000020003F8:0C000300787FE4F6D8FD75810702000F3D:00000001FF 把解释后的数据当作十六进制来观察 1.每一行数据

Java ArrayList扩容机制 (源码解读)

结论:初始长度为10,若所需长度小于1.5倍原长度,则按照1.5倍扩容。若不够用则按照所需长度扩容。 一. 明确类内部重要变量含义         1:数组默认长度         2:这是一个共享的空数组实例,用于明确创建长度为0时的ArrayList ,比如通过 new ArrayList<>(0),ArrayList 内部的数组 elementData 会指向这个 EMPTY_EL

SWAP作物生长模型安装教程、数据制备、敏感性分析、气候变化影响、R模型敏感性分析与贝叶斯优化、Fortran源代码分析、气候数据降尺度与变化影响分析

查看原文>>>全流程SWAP农业模型数据制备、敏感性分析及气候变化影响实践技术应用 SWAP模型是由荷兰瓦赫宁根大学开发的先进农作物模型,它综合考虑了土壤-水分-大气以及植被间的相互作用;是一种描述作物生长过程的一种机理性作物生长模型。它不但运用Richard方程,使其能够精确的模拟土壤中水分的运动,而且耦合了WOFOST作物模型使作物的生长描述更为科学。 本文让更多的科研人员和农业工作者

MOLE 2.5 分析分子通道和孔隙

软件介绍 生物大分子通道和孔隙在生物学中发挥着重要作用,例如在分子识别和酶底物特异性方面。 我们介绍了一种名为 MOLE 2.5 的高级软件工具,该工具旨在分析分子通道和孔隙。 与其他可用软件工具的基准测试表明,MOLE 2.5 相比更快、更强大、功能更丰富。作为一项新功能,MOLE 2.5 可以估算已识别通道的物理化学性质。 软件下载 https://pan.quark.cn/s/57

衡石分析平台使用手册-单机安装及启动

单机安装及启动​ 本文讲述如何在单机环境下进行 HENGSHI SENSE 安装的操作过程。 在安装前请确认网络环境,如果是隔离环境,无法连接互联网时,请先按照 离线环境安装依赖的指导进行依赖包的安装,然后按照本文的指导继续操作。如果网络环境可以连接互联网,请直接按照本文的指导进行安装。 准备工作​ 请参考安装环境文档准备安装环境。 配置用户与安装目录。 在操作前请检查您是否有 sud

线性因子模型 - 独立分量分析(ICA)篇

序言 线性因子模型是数据分析与机器学习中的一类重要模型,它们通过引入潜变量( latent variables \text{latent variables} latent variables)来更好地表征数据。其中,独立分量分析( ICA \text{ICA} ICA)作为线性因子模型的一种,以其独特的视角和广泛的应用领域而备受关注。 ICA \text{ICA} ICA旨在将观察到的复杂信号

Spring 源码解读:自定义实现Bean定义的注册与解析

引言 在Spring框架中,Bean的注册与解析是整个依赖注入流程的核心步骤。通过Bean定义,Spring容器知道如何创建、配置和管理每个Bean实例。本篇文章将通过实现一个简化版的Bean定义注册与解析机制,帮助你理解Spring框架背后的设计逻辑。我们还将对比Spring中的BeanDefinition和BeanDefinitionRegistry,以全面掌握Bean注册和解析的核心原理。