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临床基础两手抓!这个12+神经网络模型太贪了,免疫治疗预测、通路重要性、基因重要性、通路交互作用性全部拿下!
生信碱移 IRnet介绍 用于预测病人免疫治疗反应类型的生物过程嵌入神经网络,提供通路、通路交互、基因重要性的多重可解释性评估。 临床实践中常常遇到许多复杂的问题,常见的两种是: 二分类或多分类:预测患者对治疗有无耐受(二分类)、判断患者的疾病分级(多分类); 连续数值的预测:预测癌症病人的风险、预测患者的白细胞数值水平; 尽管传统的机器学习提供了高效的建模预测与初步的特征重
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SHAP分析交互作用的功能,如果你用的模型是xgboost
SHAP分析交互作用的功能,如果你用的模型是xgboost 如果在SHAP分析中使用的是xgoost模型,就可以使用SHAP分析内置的交互作用分析,为分析变量间的相互提供了另外一个观察的视角。关于SHAP交互作用分析,一个参考资料,还是很值得看看。 SHAP分析内置的交互作用可视化(汇总图)。是使用R语言shapviz包实现。前提是用的模型是xgboost,还要在获得shap对象的时候将参数“
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代码+视频,R语言logistic回归交互项(交互作用)的可视化分析
交互作用效应(p for Interaction)在SCI文章中可以算是一个必杀技,几乎在高分的SCI中必出现,因为把人群分为亚组后再进行统计可以增强文章结果的可靠性,不仅如此,交互作用还可以使用来进行数据挖掘。在既往文章中,我们已经介绍了怎么使用R语言可视化visreg包对交互作用进行可视化分析(见下图) 使用visreg包后我们对图形的细节掌控力不够,今天我们视频介绍使用重新绘制手动图形,这
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R语言信用风险回归模型中交互作用的分析及可视化
全文链接:http://tecdat.cn/?p=21892 相关视频 引言 多元统计分析中,交互作用是指某因素作用随其他因素水平的不同而不同,两因素同时存在是的作用不等于两因素单独作用之和(相加交互作用)或之积(相乘交互作用)。通俗来讲就是,当两个或多个因素同时作用于一个结局时,就可能产生交互作用,又称为效应修饰作用(effect modification)。当两个因素同时存在时,所导致的效应
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【交互作用】02. 加法交互 乘法交互 (R包 interactionR)
【交互作用】02. 加法交互 & 乘法交互 [R包 interactionR] 1. 原理和方法回顾2. `interactionR` R包介绍 生物学交互作用的评价应该基于是否有相加交互作用, 而流行病学研究中常运用logistic和Cox等广义线性模型, 并纳入乘积项分析因素间交互作用,其是否有意义仅反映相乘交互作用, 并不能反映两因素间相加或生物学交互作用的有无。上篇【交互作
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6-交互作用图
6-交互作用图 6.0 交互作用图 包括顺序图和通信图,为系统的动态方面建模。交互作用图描述了对象间的交互作用,由对象、对象间的关系组成 顺序图和通信图以不同的方式表达了类似的信息。顺序图描述消息的时间顺序,适合于描述实时系统和复杂的脚本;通信图描述对象间的关系。两者在语义上相当,彼此转换而不损失信息。 6.0.1交互作用图主要组成元素 对象 连接 消息 包含注释和约束 6.0.1
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拓端tecdat|R语言信用风险回归模型中交互作用的分析及可视化
最近我们被客户要求撰写关于信用风险回归模型研究报告,包括一些图形和统计输出。 视频:R语言生存分析Survival analysis原理与晚期肺癌患者分析案例 R语言生存分析Survival analysis原理与晚期肺癌患者分析案例 引言 多元统计分析 中,交互作用是指某因素作用随其他因素水平的不同而不同,两因素同时存在是的作用不等于两因素单独作用之和(相加交互作用)或之积(
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“解耦表示学习”+“交互作用(效应)+权衡 (Trade-off)”是什么?
一、解耦表示学习 一个例子说明问题: 假设我们有一组人脸图像。图像中的每张人脸都可能由多种因子组成,如面部表情、发型、眼镜、性别等。解耦表示学习的目标是找到一种表示方法,其中每一部分的表示只对应于一个因子,如一个特征只对应于面部表情,另一个特征只对应于发型等。这样,如果我们希望生成一个新的人脸图像,我们可以单独选择每个因子,如选择笑脸的面部表情和短发的发型,而不需要关心其他因子。 具体
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