论文题目：MDF-SA-DDI: predicting drug–drug interaction events based on multi-source drug fusion, multi-source feature fusion and ransformer self-attention mechanism 论文来源： Briefings in Bioinformatics,00(

https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/msystems.00320-22 题目：Metabolism Interactions Promote the Overall Functioning of the Episymbiotic Chemosynthetic Community of Shinkaia crosnieri of Cold Seep

蛋白质是一类由20种不同氨基酸组成的大分子有机化合物，它们是生命体内各种生物活动的最主要的执行者。蛋白质的绝大多数生物学功能都是通过与其它蛋白质的相互作用来实现。因此，蛋白质-蛋白质相互作用（简称‘蛋白质互作’）在生命功能的实现以及生物的进化过程中都扮演极其重要的角色。例如，抗体和抗原蛋白的相互作用，帮助生命个体识别和抵御外界病原体的入侵；受体和配体蛋白的相互作用，触发细胞信号传导通路；转录因子和

​​​​​​​目录 前记 一、Cytoscape3.7.1的下载 二、输入文件的预览 三、蛋白质互作网络的绘制 四、HUB基因的计算和查找 后记 前记 Cytoscape是一种常用的生物信息学软件，可以用于制作蛋白质互作网络并寻找核心基因。通过Cytoscape，我们可以将大量的蛋白质互作数据进行可视化展示，以便更好地理解蛋白质之间的相互作用关系。 在制作蛋白质互作网络时，我

How to prepare structures for HADDOCK? – Bonvin Labhttps://www.bonvinlab.org/software/bpg/structures/RosettaDock: 蛋白-蛋白复合物对接预测 - 知乎 (zhihu.com) 要进行LPR1-SEPP1复合物的结合亲和力预测，您可以按照以下步骤进行： 获取蛋白质结构数据：首先，

KEGGgraph 包可以解析kgml 文件，从中得到不同对象之间的网络结构，并在此基础上进一步挖掘其中的信息。 KEGGgraph 包提供了以下3种基本功能： 将kgml 文件转换为基因互作网络 用法示例 # 读取hsa00020xml 文件> mapkG <- parseKGML2Graph("hsa00020.xml",expandGenes=TRUE, genesOnly = TRUE

绘制驱动疾病进展的基因调控网络，可以筛选出针对疾病的核心调控基因，从而为疾病治疗提供更有效的方法。 2023年5月31日，题为Transfer learning enables predictions in network biology的文章发表于《Nature》。 摘要 构建基因网络需要利用大量的转录组数据来学习基因之间的相互关系,这限制了基因网络在数据有限的情形下的应用,包括罕见病和难以

GIVE 中 添加互作基因 1. 第一种方法1. 第二种方法 (推荐) 1. 第一种方法 文件会随着时间的推移而改变 -- 创建一个表, 只需改动数据库名和表名即可CREATE TABLE `hg19`.`a` (`ID` int(10) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT,`chrom` varchar(255) NOT NULL DE

❝之前给大家介绍了AlphaFold预测结果可视化软件Chimera( 点击此处阅读)以及如何利用 ChimeraX软件美化蛋白结构( 点击此处阅读)；利用AlphaFold预测蛋白互作后我们最想知道的是互作位点和界面，本期我们将介绍如何使用 ChimeraX分析蛋白互作界面。 ❞ 蛋白质的三级结构和四级结构的作用力主要有「疏水作用、离子键、氢键和范德华力」等,利用ChimeraX可以分析

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 组蛋白去乙酰化抑制剂(HDACis)在多种恶性肿瘤中显示出令人鼓舞的结果。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是最普遍的mRNA修饰，在肿瘤发生调控中起重要作用。然而，对组蛋白乙酰化和m6A RNA修饰之间的互作研究仍然未知。 2023年7月19日，上海交通大学医学院附属第九人民医院眼科庄艾、Xiang Gu、Tongxin Ge为第一作者