古细菌（archaebacteria）又叫古生菌、古菌，是一类很特殊的细菌，同时具有原核生物和真核生物的某些特征。古细菌多生活在各种极端的生态环境中，它们代表了生命的极限，确定了生物圈的范围。古细菌和真细菌、真核生物一起，构成了生物的三域系统。古细菌分为泉古菌、广古菌、初古菌和纳古菌。具有代表性的古细菌有极端嗜热菌、极端噬盐菌、极端嗜酸菌、产甲烷古菌、嗜热菌、噬盐菌等。 微基生物根据文献中常用的古

与细菌多样性分析类似，在真核微生物中也有三类核糖体RNA（rRNA），包括5.8S rRNA、18S rRNA和28S rRNA。 18S rRNA基因是编码真核生物核糖体小亚基的DNA序列，其中既有保守区，也有可变区（V1-V9，没有V6区）。保守区域反映了生物物种间的亲缘关系，而可变区则能体现物种间的差异，适用于作种级及以上的分类标准。其中，V4区是文献中常用的检测片段。   真核微生物

“split_libraries.py” 和“split_libraries_fastq.py”实现数据拆分和数据过滤的双重目的。Mothur利用“Trim.seqs”。不过QIIME和Mothur都不能直接处理sff文件(454下机产生的数据格式)，不过可各自利用“process_sff.py”和Sffinfo将sff格式转换为FASTA和QUAL文件。 数据过滤考虑的参数有：minimum

qiita（https://qiita.ucsd.edu/）是一个用于微生物组学研究的在线工具和资源库平台。 上传数据 注册并登陆 准备样品序列文件及meta信息和preparation文件 样品序列文件：后缀可以为fastq，fastq.gz，fasta，fna，不可以为fq等 meta文件：后缀可以为txt和tsv，第一列列名必须为sample_name，后面各列为样品meta

谷禾健康 当谈到肠道菌群研究时，16S测序是一种常用的方法，它在了解微生物组成和多样性方面非常重要且实用。 16S rRNA是细菌和古细菌中的一个高度保守的基因片段，同时具有一定的变异性。通过对16S rRNA基因进行测序，可以确定微生物群落中存在的不同菌属和菌种，并评估它们的相对丰度。 针对肠道菌群16s测序概括起来可以了解以下内容： 揭示微生物组成：通过16S rRNA测序，可以获得关于肠道

谷禾健康 当谈到肠道菌群研究时，16S测序是一种常用的方法，它在了解微生物组成和多样性方面非常重要且实用。 16S rRNA是细菌和古细菌中的一个高度保守的基因片段，同时具有一定的变异性。通过对16S rRNA基因进行测序，可以确定微生物群落中存在的不同菌属和菌种，并评估它们的相对丰度。 针对肠道菌群16s测序概括起来可以了解以下内容： 揭示微生物组成：通过16S rRNA测序，可以获得关于肠道

这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。 核糖体RNA(rRNA)是细胞内含量最高的一类RNA，占胞内所有RNA总量的80％以上。其与蛋白质结合形成核糖体，在mRNA的序列引导下转运特定的氨基酸合成蛋白质肽链。由于核糖体RNA的占比含量极高，在总RNA测序研究其它功能性RNA的表达丰度、修饰状态等，核糖体RNA将侵占大量的可用数据，如何在检测前针对不同物种有效的去除核糖体RNA，或