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在线绘制哑铃图(dumbbell chart)展示基因拷贝数变异(CNV)
导读: 哑铃图的名称来源于其形状,它看起来像一个哑铃,有两个圆形的“重量”在两端,通过一根“杆”连接。常用于展示两个或多个数据集之间的差异。本文介绍了如何使用哑铃图展示基因的拷贝数变异。 Journal of Translational Medicine文章《SLC26A4 correlates with homologous recombination deficiency and pa
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Word无法启动转换器RECOVR32.CNV解决方法
最近打开Word或者保存Word时总会出现“无法启动转换器RECOVR32.CNV”的报错窗口。 在网上找到了一个解决方法,亲测有效。 (1)win+R打开“运行”→输入“regedit”,进入注册表编辑器。 (2)找到HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Shared Tools Location把路径修改为带双引号的路径,例如: “C:\Progra
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【上电即上华为云】华为云smart智联PLC_NB-IoT_BLE无线网关_plc_3121N-IED_BC95-CNV
原贴地址:https://bbs.huaweicloud.com/blogs/254821 【摘要】 PLC和NB-IoT和蓝牙,碰在一块能产生什么火花?本文带来一个smart智联PLC无线网关,有PLC的大规模自组网,NB的超强网络通道,蓝牙的超便捷近端调试,当然最重要的是上电即上华为云。 一句话总结:PLC和NB-IoT和蓝牙,碰在一块能产生什么火花?本文带来一个smart智联
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什么是CNV?
CNV(拷贝数变异)是基因组遗传学中的一个术语,指的是在个体的DNA序列中与参考基因组相比存在的基因或DNA片段的拷贝数增加或减少。 这些变异可以涉及很小的DNA片段,也可能涉及数百个基因。CNV是基因组多样性的一个重要组成部分,可以影响基因表达、表型和疾病易感性。 为什么会产生CNV? CNV可以通过多种机制产生: 不均等交叉:在同源染色体或姊妹染色单体之间的交换不均衡,导致基因拷贝
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R: 使用CHAMP包进行甲基化数据的差异分析(QC, CNV, DMP, DMR等)
CHAMP: 甲基化数据的差异分析 本文介绍如何使用CHAMP包对自己的甲基化数据进行分析(QC, CNV, DMP, DMR等) 包的安装 setwd('E:/wu/R')#~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~#source("http://bioconductor.org/biocLite.R")##if faild, try the fo
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开箱即用版本 满分室间质评之GATK Somatic SNV+Indel+CNV+SV
最近准备为sliverworkspace 图形化生信平台开发报告设计器,需要一个较为复杂的pipeline作为测试数据,就想起来把之前的 满分室间质评之GATK Somatic SNV+Indel+CNV+SV(下)性能优化翻出来用一下。跑了一遍发现还是各种问题,于是想把pipeline改造成免部署、首次运行初始化环境的版本,以便需要时候能够直接运行起来,于是有了本文。 一句话描述就是:开箱即用
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CNV学习3(CNV软件使用学习--input)
PennCNV 输入文件都是文本格式。它需要信号强度文件、 HMM 文件、 PFB 文件和可选的 GCModel 文件。用户将需要准备正确的格式的信号强度文件,而所有其他文件已经捆绑在 PennCNV 软件包。下面我们描述了各种输入文件格式,并描述了从各种来源准备信号强度文件的过程。(抓重点:信号强度文件最需要自己准备!!!) 输入信号强度文件是一个文本文件,其中包含每行一个SNP的信息,并且每
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开箱即用版本 满分室间质评之GATK Somatic SNV+Indel+CNV+SV
最近准备为sliverworkspace 图形化生信平台开发报告设计器,需要一个较为复杂的pipeline作为测试数据,就想起来把之前的 满分室间质评之GATK Somatic SNV+Indel+CNV+SV(下)性能优化翻出来用一下。跑了一遍发现还是各种问题,于是想把pipeline改造成免部署、首次运行初始化环境的版本,以便需要时候能够直接运行起来,于是有了本文。 一句话描述就是:开箱即用
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