【算法分析与设计】重复的DNA

2024-04-24 23:44
文章标签 算法 分析 dna 设计 重复

本文主要是介绍【算法分析与设计】重复的DNA,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

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题目

DNA序列 由一系列核苷酸组成,缩写为 'A''C''G' 和 'T'.。

  • 例如,"ACGAATTCCG" 是一个 DNA序列 。

在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列非常有用。

给定一个表示 DNA序列 的字符串 s ,返回所有在 DNA 分子中出现不止一次的 长度为 10 的序列(子字符串)。你可以按 任意顺序 返回答案。

示例

示例 1:

输入:s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
输出:["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]

示例 2:

输入:s = "AAAAAAAAAAAAA"
输出:["AAAAAAAAAA"]

提示:

  • 0 <= s.length <= 105

思路

这个算法的思路是使用一个哈希表来记录每个长度为10的子串的出现次数。具体步骤如下:

  1. 创建一个空的 ArrayList 来存储重复出现的长度为10的子串。
  2. 创建一个 HashMap 来存储子串及其出现的次数,其中键为子串,值为子串出现的次数。
  3. 遍历字符串 s 的每个字符,从索引 0 开始直到索引 n-10。这样可以保证在截取长度为10的子串时不会超出字符串的范围。
  4. 在每次迭代中,使用 s.substring(i, i + 10) 截取长度为10的子串。
  5. 将截取得到的子串作为键,查询哈希表中是否已经存在该子串。如果存在,则更新该子串的出现次数加1;如果不存在,则将该子串作为键,出现次数初始化为1。
  6. 检查当前子串在哈希表中的出现次数,如果等于2,则将该子串添加到结果集合中。
  7. 最后返回结果集合。

这个算法的时间复杂度是 O(n),其中 n 是字符串 s 的长度,因为需要遍历整个字符串一次。空间复杂度也是 O(n),因为需要存储哈希表和结果集合。

代码实现

class Solution {public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {List<String> ans = new ArrayList<String>();Map<String, Integer> map = new HashMap<String, Integer>();int n = s.length();for (int i = 0; i <= n - 10; ++i) {String sub = s.substring(i, i + 10);map.put(sub, map.getOrDefault(sub, 0) + 1);if (map.get(sub) == 2) {ans.add(sub);}}return ans;}
}

运行结果

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http://www.chinasem.cn/article/933165

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