本文主要是介绍scRNA-seq 数据处理流程,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
brief
最近的一篇综述讲述了单细胞数据的分析方向,包括对应的工具,准备跟着文章走一次,如下是学习记录。
Title : Complex Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data
DOI : 10.1134/S0006297923020074
目前的学习路径如下:
(每个步骤细节还蛮多的,放在一起就太臃肿且不好组织了,分开学习分开记录,有需要的点击超链接。)
1.构建Seurat 对象
2.Pro-process:QC & 过滤细胞
3.Normalizing the data
4.Feature select
5.scale data
6.RunPCA
7.cluster
8.非线性降维+可视化
9.Cluster biomarkers:differential expression
10.Cell annotation
11.Cell-cell intraction
这篇关于scRNA-seq 数据处理流程的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!