本文主要是介绍TCGA超过1G的病理wsi数据下载-gdc-client，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！
使用网页端下载TCGA超过1G的病理wsi数据，数据下载到1G后就不能完整下载。遂采用gdc-client下载。
Win 环境下新建这个文件夹放在系统盘进行储存，否则会报错：ERROR: Unable to write state file: [WinError 17] 系统无法将文件移到不同的磁盘驱动器。好像是
TCGA数据集下载及gdc-client相关问题汇总_gdc client error-CSDN博客
gdc-client软件及环境
下载GDC Data Transfer ToolGDC (cancer.gov)
安装到自己需要的位置，英文路径，Windows需要进行环境变量配置
打开电脑控制面板——系统和安全——系统——高级系统设置——环境变量——Path——“加入你的gdc-client所在路径” （点击放置gdc-client的文件夹名复制即可），然后应用保存。
TCGA数据下载教程：使用官方gdc-client软件下载-CSDN博客
打开CMD命令行窗口输入 gdc-client -h 然后回车，成功将会显示：
gdc-client -h
Manifest及病理svs数据下载
将需要下载的数据从TCGA上加入购物车，然后下载Manifest.txt文件
将文件放置于配置环境变量及gdc软件的文件夹
然后右击选在→在终端中打开（cmd）输入“gdc-client download -m gdc_manifest自己的.txt”回车下载
gdc-client download -m gdc_manifest自己的.txt现在即可下载超过1G的病理WSI文件。
接下来就可以使用qupath软件进行查看和分析
Projects — QuPath 0.5.0 documentation
TCGA的gdc-client的下载优化_gdc 下载没速度-CSDN博客
这篇关于TCGA超过1G的病理wsi数据下载-gdc-client的文章就介绍到这儿，希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助！
