本文主要是介绍RNA-seq数据库(ChatGPT),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
截至我最后更新知识的时间(2022年1月),存在许多RNA测序(RNA-seq)数据库,这些数据库提供了大量的基因表达和转录组学数据。以下是一些常见的RNA-seq数据库的例子:
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NCBI Gene Expression Omnibus (GEO):
- 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
- 提供了广泛的基因表达数据,包括RNA-seq、微阵列等多种平台的数据。
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European Bioinformatics Institute (EBI) ArrayExpress:
- 网址:https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/
- 包含各种功能基因组学实验数据,包括RNA-seq。
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The Cancer Genome Atlas (TCGA):
- 网址:https://www.cancer.gov/tcga
- 提供了多种癌症类型的高通量分子数据,包括RNA-seq。
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Sequence Read Archive (SRA):
- 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/
- 存储了来自各种实验的高通量测序数据,包括RNA-seq。
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ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements):
- 网址:ENCODE
- 提供了人类基因组的详细注释和多种细胞类型的RNA-seq数据。
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GTEx (Genotype-Tissue Expression):
- 网址:https://www.gtexportal.org/home/
- 包含多个组织和器官的基因表达数据,用于理解基因在不同组织中的表达模式。
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Functional Annotation of the Mammalian Genome (FANTOM):
- 网址:http://fantom.gsc.riken.jp/
- 提供了大量的转录组学数据,用于理解基因的功能和调控。
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Allen Brain Atlas:
- 网址:Allen Institute - Unlocking the Mysteries of Us
- 提供了大脑组织中基因表达的详细图谱,包括RNA-seq数据。
请注意,这只是一小部分可用的RNA-seq数据库。领域中仍然存在其他专门化的数据库,以及不断有新的数据库涌现。因此,你可能需要查看最新的文献和资源以获取更新的信息。
这篇关于RNA-seq数据库(ChatGPT)的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!