重测序项目文章 | Fungal Diversity（IF:20.3）发表杯伞科真菌系统分类和毒蝇碱进化的研究

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Clitocybaceae（杯伞科）是近期建立的真菌家族。目前，由于取样和用于系统发育分析的基因有限，该家族内的亚科分化和关系尚不清晰。该家族的一些蘑菇含有神经毒性毒蕈碱，导致全球范围内许多严重甚至致命的中毒事件。然而，该家族内毒素的分类分布和演化大部分仍然未知。

2023年11月27日，中国科学院昆明植物研究所杨祝良研究员团队在期刊Fungal Diversity（IF:20.3）发表题为“Systematic arrangement within the family Clitocybaceae (Tricholomatineae, Agaricales): phylogenetic and phylogenomic evidence, morphological data and muscarine‑producing innovation”的研究论文。该研究基于ITS和六个分子位点（ITS、LSU、TEF1、RPB1、RPB2和ATP6）的核苷酸序列进行了系统发育分析，同时进行了基于485个单拷贝同源基因的系统发育基因组学分析。采用BEAST分析法来估计家族内的分化时间，并对32个代表性物种的毒蕈碱进行了生化分析。

基于这些分析，提出了Clitocybaceae的更新分类，包括六个属：杯伞属（Clitocybe）、金钱菌属（Collybia）、树状金钱菌属（Dendrocollybia）、香蘑属（Lepista）、假离褶伞属（Pseudolyophyllum）和囊泡杯伞属（Singerocybe）。还提出了17种中国新种和15种新组合。此外，在18种物种中检测到毒蕈碱，这些含毒蕈碱的物种在Collybia亚属中形成了一个主要的单系分支。最后，系统发育、系统发育基因组学、化学分类和分子测定年龄结果表明，Clitocybaceae是一个自然群，估计起源于约6000万年前，并且在该家族中，毒蕈碱大约在2000万年前仅经过一次独立演化，并且之后未发生丢失。爱基百客为该研究提供重测序的服务。