R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30605

应用关联规则、聚类方法等数据挖掘技术分析治疗的中药专利复方组方配伍规律（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。

方法检索治疗中药专利复方，排除外用中药及中西药物合用的复方。最近我们被要求撰写关于用药规律的研究报告，包括一些图形和统计输出。对入选的中药专利复方进行术语规范化等处理，抽取信息、建立表，应用数据分析软件R对数据进行关联规则分析，应用网络分析软件进行聚类分析。

相关视频

查看数据

转换成二值矩阵数据

colnames(data) <- paste0("X",1:ncol(data))database <- NULL
for(i in 1:nrow(data)) {tmp <- integer(length(total_types))

建立apriori

plot(all_rules, method = "graph")

点击标题查阅往期内容

R语言用关联规则和聚类模型挖掘处方数据探索药物配伍中的规律

左右滑动查看更多

01

02

03

04

中药专利复方中药对的关联规则分析

药对是方剂配伍的基本形式，它反映了中药之间相辅相成、相反相成、同类相从等配伍关系。药对中的中药在组方配伍时具有在处方中同时出现的特点，因此在关联规则分析中，分析置信度较大且双向关联的规则即可得到药对。 

根据置信度和支持度筛选强关联规则

K-means均值网络聚类分析

抑郁症中药专利复方中药物之间形成了一个复杂的配伍关系网络，关联规则分析可以用来发现其中的药对及强关联规则，但随着支持度和置信度阈值参数的降低，关联规则大量涌现，使得其中的配伍规律变得难以分析，应用网络聚类方法可以有效地发现其中的配伍规律。

#聚类类别号
kmod$cluster

查看每个类别中的强关联规则

聚类1

聚类2

配伍关系网络的聚类分析结果显示了抑郁症治疗中常用的中药“社团”，反映了复方中一些配伍关系相对密切、固定的中药联合，临床运用可以提高疗效。

点击文末“阅读原文”

获取全文完整代码数据资料。

本文选自《R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类数据挖掘中药专利复方治疗用药规律网络可视化》。

点击标题查阅往期内容

非线性混合效应 NLME模型对抗哮喘药物茶碱动力学研究

Python面板时间序列数据预测：格兰杰因果关系检验Granger causality test药品销售实例与可视化

R语言用关联规则和聚类模型挖掘处方数据探索药物配伍中的规律

用SPSS Modeler的Web复杂网络对所有腧穴进行关联规则分析

PYTHON在线零售数据关联规则挖掘APRIORI算法数据可视化

R语言关联规则模型(Apriori算法)挖掘杂货店的交易数据与交互可视化

R语言关联挖掘实例（购物篮分析）

python关联规则学习：FP-Growth算法对药品进行“菜篮子”分析

基于R的FP树fp growth 关联数据挖掘技术在煤矿隐患管理

python关联规则学习：FP-Growth算法对药品进行“菜篮子”分析

通过Python中的Apriori算法进行关联规则挖掘

Python中的Apriori关联算法-市场购物篮分析

R语言用关联规则和聚类模型挖掘处方数据探索药物配伍中的规律

在R语言中轻松创建关联网络

python主题建模可视化LDA和T-SNE交互式可视化

R语言时间序列数据指数平滑法分析交互式动态可视化

用R语言制作交互式图表和地图

如何用r语言制作交互可视化报告图表

K-means和层次聚类分析癌细胞系微阵列数据和树状图可视化比较

KMEANS均值聚类和层次聚类：亚洲国家地区生活幸福质量异同可视化分析和选择最佳聚类数

PYTHON实现谱聚类算法和改变聚类簇数结果可视化比较

有限混合模型聚类FMM、广义线性回归模型GLM混合应用分析威士忌市场和研究专利申请数据

R语言多维数据层次聚类散点图矩阵、配对图、平行坐标图、树状图可视化城市宏观经济指标数据

r语言有限正态混合模型EM算法的分层聚类、分类和密度估计及可视化

Python Monte Carlo K-Means聚类实战研究

R语言k-Shape时间序列聚类方法对股票价格时间序列聚类

R语言对用电负荷时间序列数据进行K-medoids聚类建模和GAM回归

R语言谱聚类、K-MEANS聚类分析非线性环状数据比较

R语言实现k-means聚类优化的分层抽样(Stratified Sampling)分析各市镇的人口

R语言聚类有效性：确定最优聚类数分析IRIS鸢尾花数据和可视化

Python、R对小说进行文本挖掘和层次聚类可视化分析案例

R语言k-means聚类、层次聚类、主成分（PCA）降维及可视化分析鸢尾花iris数据集

R语言有限混合模型(FMM,finite mixture model)EM算法聚类分析间歇泉喷发时间

R语言用温度对城市层次聚类、kmean聚类、主成分分析和Voronoi图可视化

R语言k-Shape时间序列聚类方法对股票价格时间序列聚类

R语言中的SOM(自组织映射神经网络)对NBA球员聚类分析

R语言复杂网络分析：聚类（社区检测）和可视化

R语言中的划分聚类模型

基于模型的聚类和R语言中的高斯混合模型

r语言聚类分析：k-means和层次聚类

SAS用K-Means 聚类最优k值的选取和分析

用R语言进行网站评论文本挖掘聚类

基于LDA主题模型聚类的商品评论文本挖掘

R语言鸢尾花iris数据集的层次聚类分析

R语言对用电负荷时间序列数据进行K-medoids聚类建模和GAM回归

R语言聚类算法的应用实例