ggplot2初阶_散点图（geom_point）

散点图（geom_point）_ggplot2初级

上一篇更新了ggplot2的初步认识，其中aes没有做一个很好的解释，英文翻译过来是美学。后来我仔细想了下，可以理解为建立了图的框架，就像你在纸上圈了一块，用这块作图，当然也包括X和Y分别是什么，以及作图的颜色和样式，可圈可点。关于ggplot2的语法会在每个图的讲解不断完善。这篇介绍个最简单的散点图。

1. 用法

geom_point(mapping=NULL, Data=NULL, stat="identity",na.rm=FALSE,show.legend=NA,interit.aes=TRUE)

• mapping

由aes()创建的美学映射集。如果指定inherit. aes = TRUE(默认)，它与绘图顶层的默认映射相结合，就是说与ggplot中的aes一致。如果没有plot mapping，则必须提供mapping。

• data

默认值NULL调用ggplot()中的数据。

• stat

数据转换函数。

• position

位置调整。

• na.rm

逻辑术语，缺失值的处理，默认FALSE,不删除缺失值，如果没有就不用管这个参数。

• show.legend

逻辑术语，是否展示图例。

2. Aesthetics

geom_point()用aesthetics的要求

• x —— x轴
• y——y轴
• alpha——设置透明度
• colour——设置颜色
• fill——形状的填充
• group——分组
• shape——设置形状
• size——形状大小
• stroke

3.绘图

数据读取

data<-read.csv("point.csv",header = T,row.names = 1)#读取数据

library(ggplot2)
ggplot(data,aes(Count,Pathway))+geom_point()#基础图形

ggplot(data,aes(Count,Pathway))+geom_point(aes(size=Generatio))#采用aes函数美化,采用Genratio调整点的大小

ggplot(data,aes(Count,Pathway))+geom_point(aes(size=Generatio,colour=-1log10(PValue)))#根据PValue调整点的颜色

ggplot(data,aes(Count,Pathway))+geom_point(aes(size=Generatio,colour=-1log10(PValue)),stroke=3,shape=5)#设置形状和边的粗细

ggplot(data,aes(Count,Pathway))+geom_point(aes(size=Generatio,colour=-1*log10(PValue)),stroke=3,shape=5)+scale_colour_gradient(low="yellow",high="red")#设置个颜色梯度这样就很美了

4. 注意事项

有个问题，就是当你shape，size，color设置成固定值时候，你可以直接在geom_point（）里面写，不用写aes，当写aes时候一般shape，size，color是随某个因子变化的。geom_point()中的shape有如下种类：