关于Conda中Rdkit报错ImportError:无libboost_python动态库问题解决方法--安装至指定目录

问题解析

libboost_python36.so.1.73.0报错信息解析：

1. 缺少的包名为boost
2. 该库支持语言为python3.6
3. boost包版本为1.73.0

报错原因有两点：

1. boost包未安装
2. 编译时使用了python2，未指定python3.6

解决方法

1. boost包下载

下载地址：boost_1_73_0.tar.gz

2. boost包编译安装

a) 依赖库检查与更新（需要联网，可跳过）

$ sudo apt-get update  
// 搜到所有的boost库
$ sudo apt-cache search boost
// 安装相应缺少的库 
$ sudo apt-get install libboost-all-dev

b) 解压boost包

// 搜到所有的boost库
$ tar -xzvf [你的下载boost包路径]/boost_1_73_0.tar.gz 

解压后会得到boost_1_73_0文件夹，如下图所示
c) 编译boost 1.73.0
此过程在自定义Conda环境中完成，若在base环境，则需要将envs/[创建的conda环境名]部分删掉，具体查看对应路径后即可明白。

// 进入boost_1_73_0目录
$ cd boost_1_73_0
//设置并运行sh文件,运行完如图2所示
//设置anaconda的python路径, 此处为自定义环境中的python3.6.5(查看python版本命令 python -V)
$  ./bootstrap.sh --with-libraries=python --with-toolset=gcc --with-python="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]/bin/python3.6m"  --with-python-version=3.6 --with-python-root="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]" --prefix="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]" --exec-prefix="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]"
//运行完成如图3所示
$ ./b2 --with-python include="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]/include/python3.6m" --prefix="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]" --exec-prefix="/home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]"
//安装，运行完成如图4所示
$ ./b2 install

d)编译过程图
i. 运行bootstrap.sh过程
ii. 运行b2文件过程
iii. 安装过程

iv. 检验是否编译成功：
查看制定安装路径下（–prefix后的参数值），是否有libboost_python36相关文件，如图5所示

e)建立软连接

$ ln -s libboost_python-py36.so /home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]/lib/libboost_python3.so
$ ln -s libboost_python-numpy36.so /home/[用户名]/anaconda3/envs/[创建的conda环境名]/lib/libboost__python-numpy3.so

参考博客

[1] libboost_python3.6编译过程记录
[2] 基于python3.6的libboost库安装（用于anaconda3安装caffe）
[3] caffe安装–安装libboost（基于python3.6）的库部分