生信文献 | 在基底细胞样乳腺癌中，ANXA4通过与ANXA1相互作用激活JAK-STAT3信号通路...

文章地址:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32552056/

标题：ANXA4 Activates JAK-STAT3 Signaling by Interacting with ANXA1 in Basal-Like Breast Cancer

Gene ：ANXA4

膜联蛋白A4(由ANXA4基因编码)是一种钙离子(Ca2+)-和磷脂结合蛋白的膜联蛋白家族。据报道，在多种类型的肿瘤中，包括结直肠癌、肺癌、胃癌、胰腺癌、胆囊癌、乳腺癌、肾癌和卵巢癌，都存在异常的ANXA4表达。

这篇文章我没查影响因子的时候，以为4分左右，觉得实验验证比一般的生信文章丰富，结果不到3分，没想到，这是生信+实验的文章中，实验占大多数。

首先作者分析了TCGA数据库的数据，在BLBC中，ANXA4上调与较差的生存率相关。

然后在动物水平上验证该基因的功能。就是干扰该基因后，看肿瘤的生长情况，干扰抑制肿瘤增殖。

接下来就是进一步就是探究ANXA4是如何促进肿瘤生长的，通过单基因GSEA分析，找到了ANXA4激活了BLBC细胞中的JAK-STAT3信号。做的是基因到信号通路的思路。

接下来作者找到了一个与ANXA4互作的蛋白，参与JAK-STAT3信号的调节，找到互作蛋白的方法是利用GeneMANIA工具预测的，预测的结果很多，如何找到你要的蛋白是很重要的，一个是知识储备，二是文献检索，找最相关的，比如参与JAK-STAT3信号调节的，ANXA1已被鉴定为BLBC中的癌蛋白，可调节STAT3的磷酸化，所以就做ANXA1，当然，可能需要做几个最相关的，出来什么就是什么。实验验证就是荧光共定位，IP。结果表明在MDA-MB-231细胞中，ANXA4与ANXA1相互作用，协同激活JAK-STAT3信号。

文章思路很简单，我看文献就是这样，细节没看。