本文主要是介绍两个基因相关性CPTAC蛋白组数据,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
目录
蛋白数据下载
①蛋白数据下载
1,TCGA-选择泛癌数据
2,TCGA-TCPA
3,CPTAC(非TCGA)
②蛋白相关性分析
1,数据整理
2,蛋白相关性分析
PCAS在线分析
蛋白数据下载
CPTAC蛋白组学数据库介绍及数据下载分析 – 王进的个人网站 (jingege.wang)
①蛋白数据下载
可以下载泛癌蛋白数据:UCSC Xena (xenabrowser.net)
1,TCGA-选择泛癌数据
dataset: protein expression - RPPA进行数据下载
https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/TCGA-RPPA-pancan-clean.xena.gz; Full metadata
蛋白数据为标准化后的数据,存在负值。
TCGA-FI-A2EY-01 | TCGA-DF-A2KS-01 | TCGA-A5-A1OH-01 | TCGA-AX-A2H7-01 | TCGA-AX-A2HA-01 | TCGA-A5-A2K4-01 | TCGA-EY-A2OM-01 | TCGA-EY-A2ON-01 | TCGA-E6-A2P8-01 | TCGA-E6-A2P9-01 | |
ACC1 | 2.375 | 0.5006 | -0.2345 | 0.4286 | -1.098 | -0.6596 | 0.05107 | -0.8085 | -0.04372 | -0.5503 |
这篇关于两个基因相关性CPTAC蛋白组数据的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!