alphafold2专题

BioTech - 研发 AlphaFold2 使用自定义 MSA 与 Template 的组合框架

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/137835482 AlphaFold2 是蛋白质结构预测算法，使用 MSA(多序列比对) 特征和 Template(模版) 特征，来提高预测的准确性。 MSA 特征：利用进化信息来预测蛋白质结构，通过比较

两大顶级AI算法一起开源！Nature、Science齐发Alphafold2相关重磅，双厨狂喜～

来源：量子位（ID：QbitAI）本文约2000字，建议阅读8分钟我们的成果可以帮助整个科学界，为生物学研究加速。喜大普奔！近日一波Nature、Science齐发文，可把学术圈的嗑盐人们高兴坏了。一边是“AI界年度十大突破”AlphaFold2终于终于开源，登上Nature。另一边Science又出报道：华盛顿大学竟然还搞出了一个比AlphaFold2更快更轻便的算法，只需要一个

PSP - 配置 AlphaFold2 的高效 Tensorflow 运行环境

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/130560538 AlphaFold2 是由 DeepMind 开发，可以根据蛋白质的氨基酸序列预测其三维结构，准确度经常可以与实验相媲美。DeepMind 和 EMBL 的欧洲生物信息学研

AlphaFold2预测结构能否直接用于虚拟筛选？

AlphaFold2预测结构能否直接用于虚拟筛选？ AlphaFold2已经从CASP14大会上横空出世了好久，也对外共享了预测结构数据库AlphaFold Protein Structure Database。对于做CADD的人而言，以前很多没有结构的蛋白靶点也终于有了结构数据可供分析计算。因此，AlphaFold2预测的海量结构能否直接用于开展虚拟筛选？以下结论与结果来自发表在Protei

Alphafold2蛋白质结构预测AI工作站配置推荐

AlphaFold2计算特点蛋白质三维结构预测是一项计算量非常巨大的任务，科学家多年的探索研究，形成了X射线晶体学法、核磁共振法、冷冻电镜等。 2021年底，谷歌的DeepMind团队的采用人工智能方法的AlphaFold2算法在生物界引起了极大的轰动，它能准确地预测蛋白质的结构，AlphaFold2是当今预测蛋白质3D结构的最强工具。它将被大量用于推动世界蛋白质研

AlphaFold2-蛋白质结构预测

通常来说，蛋白质的结构可分为４个层次（见图２）．（１）一级结构是指构成蛋白质的残基序列；（２）在蛋白质的局部片段上，常常会观察到主链上的周期性规则构象，比如α 螺旋和β片层等，这种周期性的规则主链构象被称为二级结构；（３）蛋白质的三级结构是指由多个二级结构单元拼装而成的具有紧密形态的三维空间结构；（４）四级结构描述由不同多肽结构链间相互作用形成具有

PSP - 蛋白质结构预测 AlphaFold2 的结构模版 (Template) 搜索与特征逻辑

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132427617 结构模版 (Template) 是一种已知的蛋白质结构，可以作为 AlphaFold2 蛋白质结构预测的参考，AlphaFold2 可以从多个数据库中搜索和选择最合适的模板，也可以使用自定义的

从AlphaFold到AlphaFold2，破解蛋白质结构终极难题

蛋白质对生命来说不可或缺，它们支持生物体的几乎所有功能。这些复杂的大分子由氨基酸链构成，而蛋白质的功能很大程度上决定于它的3D结构。显然，了解蛋白质的结构和形状对医药研究的进步至关重要。生物医学领域的众多挑战，包括开发治疗疾病的创新疗法，都依赖于对蛋白质结构和功能的理解。但是，由于蛋白质结构极其复杂，到现在为止，医学上也只研究出少数蛋白质的构造。但是，这一情况随着用人工智能确定蛋白质

PSP - 蛋白质复合物 AlphaFold2 Multimer MSA Pairing 逻辑与优化

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/134144591 在蛋白质复合物结构预测中，当序列 (Sequence) 是异源多链时，无论是AB，还是AABB，都需要 MSA 配对，即 MSA Pairing。在 MSA 的搜索过程中，按照单链维度进行搜索

128张GPU炼出中国版AlphaFold2：训练代码全开源，打开浏览器就可体验，北大元培系AI公司打造...

杨净梦晨发自凹非寺量子位报道 | 公众号 QbitAI 中国版AlphaFold2，来了！ Uni-Fold，官宣即开源，还为科研者提供了测试接口和在线试用。半年前，AlphaFold2和RoseTTAFold两个顶级AI算法齐齐引发生物学界、AI学界大地震。半年后，这个横空出世的Uni-Fold，不光能完整复现AlphaFold2。其预测精度超过RoseTTAFold、与Alph

PSP - AlphaFold2 的 2.3.2 版本源码解析 (1)

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/130323566 时间：2023.4.22 官网：https://github.com/deepmind/alphafold AlphaFold2是一种基于深度学习的方法，根据氨基酸序列预测