文章目录 一、序列下载与整理下载fasta格式序列合并多个fasta文件 二、多序列比对软件下载安装序列比对 三、进化树分析四、保守位点分析 一、序列下载与整理 下载fasta格式序列 0、输入网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene 1、输入你想查找的序列，比如Syp基因 可以点击图片来查看高清图 2、进入基因详细信息页面

V.PhyloMaker2是一个R语言的工具包，专门用于构建和分析生物系统学中的进化树（也称为系统发育树或phylogenetic tree）。以下是对V.PhyloMaker2的一些基本介绍和使用说明： 论文介绍：V.PhyloMaker2: An updated and enlarged R package that can generate very large phylogenies f

资源介绍：GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database | Bioinformatics | Oxford Academic (oup.com) GTDB - Genome Taxonomy Database (ecogenomic.org) 大家自己看吧，不在解释了，直接上安装和配置，

V.PhyloMaker2是一个R语言的工具包，专门用于构建和分析生物系统学中的进化树（也称为系统发育树或phylogenetic tree）。以下是对V.PhyloMaker2的一些基本介绍和使用说明： 论文介绍：V.PhyloMaker2: An updated and enlarged R package that can generate very large phylogenies f

基因表达数据分析和实验设计密不可分，总体来说，实验设计有两大类思路：一类是时间序列分析，主要思想是测定基因多个时间点的表达值，通过聚类和主成分分析等分析手段寻找调控基因，进而研究其深层机制；第二类是基因表达差异的限制性分析。         所谓GO注释，就是将表示基因或其产物的ID映射到一组GO的ID上，用这组GOterm来描述这个基因。而实际应用中，人们更关心一组基因（比如差