刚换了一个新课题组，新老板的研究方向为蛋白组学，从未接触过蛋白组学的我准备找一组模拟数据进行生信分析的入门学习。 蛋白组学数据挖掘流程图，参考公众号：蛋白质组学数据挖掘思路解析 (qq.com) 一、认识数据 我们组的数据主要是：MaxQuant搜库结果，我没有去实操一遍MaxQuant，所以这里引用网上资源蛋白质组学第6期 搜库软件之 MaxQuant 结果数据介绍-腾讯云开发者社区-

基于RPPA靶向蛋白组学的CellBox模型在癌症联合治疗中的应用 由于肿瘤细胞在治疗环境变化和疾病进程产生的耐药性和多克隆抗性，使传统的单一药物治疗已不能满足肿瘤研究的现状，而由于样本和实验条件的限制，配对样本或者大队列实验的开展、通过探索性实验的结果来确定潜在治疗靶点等方式都具有挑战性，因此通过计算模型的方法对靶向组合进行预测，已成为研究靶向组合治疗的方法之一。 在计算模型中，如何更大规模

生信学习day1-蛋白组分析 蛋白质组差异分析的三个R包 - 知乎 (zhihu.com)https://zhuanlan.zhihu.com/p/448479536Introduction to DEP (bioconductor.org)http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DEP/inst/doc/DEP.h