科研专题
科研绘图系列：R语言扩展物种堆积图（Extended Stacked Barplot）
介绍 R语言的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具，它不仅展示了物种的堆积结果，还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。这种图形表示方法能够直观地比较不同物种在各个分组中的显著性差异，为研究者提供了一种有效的数据解读方式。 加载R包 knitr::opts_chunk$set(warning = F, message = F)library(tidyverse)library(phyl
科研小白成长记40——第三个五年计划
小gap期间，拼命玩和拼命休息的同时，仔细思考了下我期望的五年之后的样子，gap结束，算是目标愈发清晰起来。曾经，读博的目标是成为一名independent researcher，并且具备发至少一篇顶会的能力。而现在，希望五年后的自己，成为一名good independent researcher。当然，这里的good，根据现阶段的科研榜样，已经有了具体的metrics。 首先是随时在线的深度理解
反常识！科研巨头扎堆夕阳行业？A股研发之王是它？
这是邢不行第 119 期量化小讲堂的分享 作者 | 邢不行 2023年华为研发费用再创新高，高达1600亿。 多年高研发投入让华为在一众领域遥遥领先。 研发费用占全年收入23% 遍观全球，各行各业巨头也极为重视研发。 2022年全球研发投入排名 细数它们的成功史，大抵都离不开投入研发、收入增加，继而加大研发力度，收入狂飙这一路径。 高研发投入能否作为判断公司好坏的依据？
科研绘图系列：R语言折线图（linechart plots）
介绍 在R语言中，折线图（Line Plot）是一种常用的数据可视化类型，用于展示数据随时间或有序类别变化的趋势。折线图通过连接数据点来形成一条或多条线，这些线条可以清晰地表示数据的变化方向、速度和模式。 加载R包 knitr::opts_chunk$set(warning = F, message = F)library(tidyverse)library(patchwork)li
【科研积累】机器学习的认知笔记
一、机器学习通识 机器学习，就是用模型来学习数据的规律。 大多数机器学习任务都是三步走：实例化➡️训练➡️预测。 机器学习任务按照最后一步预测，可以分为三种： 1. 分类：输出概率分布 2. 回归 3. 生成：本质上也是分类，生成的是对下一个字的分类，在字典中，每个字都是一个类别。 如果按照数据标签的完整与否来划分，则可以分为以下三类： 1. 结构化的数据（全都有标签）：用于监
【科研绘图】【3D轨线图】：附Origin详细画图流程
目录 No.1 理解3D轨线图 No.2 画图流程 1 导入数据并绘图 2 设置绘图细节 3 设置坐标轴 4 效果图 No.1 理解3D轨线图 3D轨线图，是指在三维坐标系中，通过连续的点或线段连接而成的图形，用于表示一个或多个物体在三维空间中的运动路径。这些路径可以是直线、曲线或者更复杂的轨迹，它们随时间的变化而变化，从而展示物体的动态行为。 No.2 画图
科研|基于SprinBoot+vue的科研管理系统(源码+数据库+文档)
科研管理系统 基于SprinBoot+vue的科研管理系统 一、前言 二、系统设计 三、系统功能设计 系统功能实现 后台模块实现 管理员功能实现 科研队伍功能实现 用户功能实现 四、数据库设计 五、核心代码 六、论文参考 七、最新计算机毕设选题推荐 八、源码获取： 博主介绍：✌️大厂码农|毕设布道师，阿里云开发社区乘风者计划专家博主，CSDN平台Jav
Sankey流图在老年癌症患者症状分析中的应用｜科研绘图·24-09-03
小罗碎碎念 本期推文主题｜桑基图 桑基图我们很多人都不陌生，但是大部分应该都是仅限于在文献中读到过，动手去实践的较少，在文献中的具体作用，可能也不太清楚，所以我这一期推文就来盘一盘桑基图。 本期推文共有两部分，第一部分是介绍一下桑基图的定义，并提供了一个R语言的完整代码，方便大家理解绘制桑基图的基本流程。 第二部分则是准备了一篇与老年癌症患者症状分析相关的文章，分析了桑基图在文献中的
科研论文必须要了解的25个学术网址
各位同学大家好，我是Toby老师，今天介绍一下科研论文必须要了解的25个学术网站。下述论文网站收藏内容有差异，大家可以检索比较。 1.SCI SCI（Science Citation Index）是一个学术引文数据库，收录了全球多个学科高质量的学术期刊。它由汤森路透（现为科睿唯安Clarivate Analytics）管理，旨在提供科研文献的引用分析和评估。SCI数据库被广泛用于评估学术期刊
【高校科研前沿】三峡大学黄进副教授等人在环境科学Top期刊JCP发文：人类活动如何在气候变化下影响和降低生态敏感性：以中国长江经济带为例
文章简介 论文名称：How human activities affect and reduce ecological sensitivity under climate change: Case study of the Yangtze River Economic Belt, China（人类活动如何在气候变化下影响和降低生态敏感性：以中国长江经济带为例） 第一作者及单位
【科研积累】NSAI 神经符号人工智能 学习笔记
神经符号的历史沿革 神经符号集成主要是为了利用神经网络捕捉符号和进行逻辑推理。 古早的人工智能理论，符号是其中的一个流派，是建立在数理逻辑上的，运用符号和规则，可以进行逻辑推理，使得人工智能系统具有可解释性。 符号和机器学习结合，诞生了归纳逻辑编程，简单来说就是，先给一些规则，机器学习了规则之后，提供数据集给机器，机器从规则里面搜寻，寻求一个最合适的规则结合方式，最后得到一个处理数据的程序。
科研绘图系列：R语言PCoA图（PCoA plot）
介绍 PCoA（主坐标分析，Principal Coordinate Analysis）是一种多维数据的降维技术，它用于探索高维空间中样本之间的关系。PCoA通常用于生态学、遗传学和其他领域的数据分析，以揭示样本或个体之间的相似性或差异性。 PCoA图的作用： 数据降维：PCoA可以将高维数据（如物种丰富度或基因表达数据）降维到二维或三维空间，使得数据更易于可视化和解释。样本关系展示：通
科研绘图系列：R语言差异基因四分图（Quad plot）
介绍 四分图（Quad plot）是一种数据可视化技术，通常用于展示四个变量之间的关系。它由四个子图组成，每个子图都显示两个变量之间的关系。四分图的布局通常是2x2的网格，每个格子代表一个变量对的散点图。 在四分图中，通常： 第一个子图显示变量A和B的关系。第二个子图显示变量A和C的关系。第三个子图显示变量A和D的关系。第四个子图显示变量B和C的关系。 此外，第四个子图也可以显示变量
科研绘图系列：R语言组合图形绘图
介绍 柱状图、箱线图和棒棒图组合 加载R包 # Librarylibrary(ggplot2)library(dplyr)library(forcats) 读取数据 data <- data.frame(name=c("north","south","south-east","north-west","south-west","north-east","west","east
【高校科研前沿】加州理工学院Brendan Byrne等人在Nature 正刊发文：2023年加拿大野火的碳排放
论文名称：Carbon emissions from the 2023 Canadian wildfires（2023年加拿大野火的碳排放） 第一作者及单位：Brendan Byrne（碳循环科学家|加州理工学院） 通讯作者及单位：Brendan Byrne（碳循环科学家|加州理工学院） 文章发表期刊：《Nature》（中科院1区Top期刊|最新影响因子：50.5） 期刊
翻译软件在科研中的六大应用
翻译软件在科研中的应用非常广泛，主要体现在以下几个方面： 文献翻译：科研人员可以使用翻译软件将外文文献翻译成母语，从而更容易理解和获取全球范围内的研究成果。这对于跨学科和跨语言的研究尤其重要。 数据分析：一些科研项目涉及多语言的数据集，翻译软件可以帮助将不同语言的数据标准化，方便进行比较和分析。 国际合作：在国际科研合作中，翻译软件可以帮助不同语言的研究团队之间进行有效的沟通，促进信息的交换
YOLOv8改进 | 科研必备 | 计算YOLOv8、YOLOv10模型的FPS的脚本【复制 - 粘贴 - 运行】
秋招面试专栏推荐 ：深度学习算法工程师面试问题总结【百面算法工程师】——点击即可跳转 💡💡💡本专栏所有程序均经过测试，可成功执行💡💡💡 专栏目录 ：《YOLOv8改进有效涨点》专栏介绍 & 专栏目录 | 目前已有100+篇内容，内含各种Head检测头、损失函数Loss、Backbone、Neck、NMS等创新点改进——点击即可跳转 FPS（Frames Per Sec
科研绘图系列：R语言富集火山图和通路图（volcano plot pathway）
介绍 火山图是一种用于可视化基因表达差异的分析工具，它通过二维坐标系展示基因的表达量变化和统计显著性。该图谱的x轴表示基因表达的对数变化，而y轴表示其统计显著性。利用火山图，研究者能够快速识别出在不同条件下显著差异表达的基因。 随后，通过KEGG数据库提供的通路图，研究者可以进一步分析这些差异表达基因在生物学通路中的富集情况。KEGG数据库是一个包含丰富基因和蛋白质信息的资源，涵盖了代谢、
【科研新手】如何判断自己找到的创新点是否已被发表呢？
很多人在自己的实验结果出来后再开始写论文，才发现自己的论文创新点已经被他人抢先发表了，因此我们需要做好预防措施，那么如何判断自己所找到的创新点是否已被发表了呢。 1、在纬度学术检索最新的文献并下载 2、将文献投喂到Kimi智能助手（最多可投喂50个文献） 3、将所投喂的文献进行整理 4、用mermaid格式将这些文献以流程图的形式进行总结 5、将所得代码输入流程
科研绘图系列：R语言富集通路棒棒图（lollipop plot）
介绍 在进行基因本体（Gene Ontology, GO）富集分析的结果可视化时，我们采用了棒棒图（lollipop Chart）作为展示手段。在此图表中，X轴展示的是负对数转换后的FDR（False Discovery Rate）值，即log10FDR，用于表示统计显著性的大小。每个点在X轴上的位置对应了其FDR值的大小，而Y轴通常用来表示富集到的GO术语或通路。通过这种图形表示，我们可以
科研绘图系列：R语言多组极坐标图（grouped polar plot）
介绍 Polar plot（极坐标图）是一种二维图表，它使用极坐标系统来表示数据，而不是像笛卡尔坐标系（直角坐标系）那样使用x和y坐标。在极坐标图中，每个数据点由一个角度（极角）和一个半径（极径）来确定。角度通常从水平线（或图表的某个固定参考方向）开始测量，而半径则是从原点到数据点的距离。 极坐标图用于说明以下类型的数据： 方向数据：当数据具有方向性时，例如风的方向和速度，极坐标图可以清
科研绘图系列：R语言单细胞差异基因四分图（Quad plot）
介绍 在单细胞分析领域，为了探究不同分组间同一细胞类型的基因表达差异，研究者们常采用四分图（Quad Plot）作为分析工具。该图形的横轴代表比较组1，而纵轴代表比较组2。通过这种布局，四分图能够有效地展示两组间共有的差异表达基因，从而为深入理解细胞类型在不同条件下的分子特性提供直观的视角。这种可视化方法不仅揭示了组间基因表达的异同，还有助于识别可能在生物学过程或疾病发生中起关键作用的基因。
《陈天奇：机器学习科研的十年》阅读笔记
0、作者介绍 陈天奇是机器学习领域著名的青年华人学者之一，本科毕业于上海交通大学ACM班，博士毕业于华盛顿大学计算机系，研究方向为大规模机器学习。2019年，陈天奇在Twitter上宣布自己将于2020年秋季加入CMU任助理教授，成为加入CMU的年轻华人学者之一。 在本文中，陈天奇回顾了自己做机器学习科研的十年。 1、原文 十年前，MSRA的夏天，刚开始尝试机器学习研究的我面对科研巨
以科研为本 创新突破的品牌理念 朵拉朵尚荣获2023年度影响力品牌奖
以科研为本 创新突破的品牌理念 朵拉朵尚荣获2023年度影响力品牌奖 随着国内美妆行业经过数十年的快速发展，已经形成了数千亿规模的产业链，在产业集聚、行业新技术不断涌现、产业链持续优化等背景下，美妆行业该如何通过科技创新，更好地迎接新一轮的机遇与挑战？ 如何紧跟消费者的需求变化，在激烈复杂的竞争中脱颖而出？朵拉朵尚作为知名国产美妆品牌，紧跟消费者的诉求，坚守品质，凭借自己独有的商业基因和用户口碑
ChatGPT辅助科研？三个实用建议助你高效前行
Milton Pividori 是科罗拉多大学安舒茨医学园区的一名生物医学信息学研究员，他花了一年半的时间研究如何在科研工作中更有效地运用 ChatGPT。在这篇文章中，他详细介绍了三条主要的经验。 他的观点是，如果你不清楚如何完成某个任务，就不应该依赖聊天机器人来协助你。 图｜Milton Pividori 以下是他的其他核心观点： 公众常常被误导认为这些模型具有“智能”，从而期待它
【Nature】在科研中应用ChatGPT：如何与数据对话
随着人工智能技术的迅猛发展，大型语言模型（LLMs）正逐渐成为科研领域的一种创新工具。这些模型通过自然语言处理技术，使得研究人员能够以直观的方式与数据进行交互，从而简化了数据分析和解释的过程。在《自然》杂志2024年7月25日发表的文章《CHATGPT FOR SCIENCE: HOW TO TALK TO YOUR DATA》中，作者Julian Nowogrodzki深入探讨了LLMs在科学研