浸润专题

肿瘤免疫浸润资源汇总

1、GEO数据库免疫细胞浸润(CIBERSORT/小提琴图)  https://v.qq.com/x/page/q0839wwfwaf.html 2、GEO数据库免疫浸润挖掘方向(应用在非肿瘤方向) http://www.dxy.cn/bbs/topic/40560487 3、3到11分文章解读(肿瘤免疫浸润挖掘方向) http://www.360doc.com/content/19/0

肿瘤微环境各种浸润细胞及maker(学习)

目录 Tumor Infiltrating Leukocytes(肿瘤浸润性白细胞) TISCH2数据库收录的TIL 免疫细胞的分类 28种不同免疫细胞类型 Tumor Infiltrating Leukocytes(肿瘤浸润性白细胞) Gene expression markers of Tumor Infiltrating Leukocytes | Journal for

一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(十)——Cibersort——完结

之前讲过临床模型预测的专栏,但那只是基础版本,下面我们以自噬相关基因为例子,模仿一篇五分文章,将图和代码复现出来,学会本专栏课程,可以具备发一篇五分左右文章的水平: 本专栏目录如下: Figure 1:差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考)  Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(图片仅供参考) Figure 3. 基因富集分析(图片仅供参考)  Figure

一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(九)——Estimate——倒数第二节

之前讲过临床模型预测的专栏,但那只是基础版本,下面我们以自噬相关基因为例子,模仿一篇五分文章,将图和代码复现出来,学会本专栏课程,可以具备发一篇五分左右文章的水平: 本专栏目录如下: Figure 1:差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考)  Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(图片仅供参考) Figure 3. 基因富集分析(图片仅供参考)  Figure

纯生信轻松拿下5+分文。铜死亡+免疫浸润+预后模型,快学起来吧

今天给同学们分享一篇生信文章“A novel defined risk signature of cuproptosis-related long non-coding RNA for predicting prognosis, immune infiltration, and immunotherapy response in lung adenocarcinoma”,这篇文章发表在Front

一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(七)

之前讲过临床模型预测的专栏,但那只是基础版本,下面我们以自噬相关基因为例子,模仿一篇五分文章,将图和代码复现出来,学会本专栏课程,可以具备发一篇五分左右文章的水平: 本专栏目录如下: Figure 1:差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考)  Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(图片仅供参考) Figure 3. 基因富集分析(图片仅供参考)  Figure

免疫微环境、免疫细胞浸润分析、免疫功能分析

Immune MicroEnvironment、Immune infiltration analysis 01.肿瘤免疫微环境(TIME)02.TIME的免疫特点和相关机制03.检测免疫浸润的工具3.1.基于marker gene的ssGSEA富集分析的免疫分析方法3.1.1.xCELL3.1.2.MCP-counter3.1.3.ESTIMATE3.1.4.3.1.5.ssGSEA3.1.

TCGA病理图像深度学习的肿瘤淋巴细胞浸润(文献)

Spatial Organization and Molecular Correlation of Tumor-Infiltrating Lymphocytes Using Deep Learning on Pathology Images - ScienceDirect 该文献展示了:基于13种TCGA肿瘤类型的H&E图像的肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的映射。 流程 方法使用两种CNN:

单基因泛癌+免疫浸润+实验sci思路。看完你也能轻松拿到4+以上

今天给同学们分享一篇单基因泛癌+免疫浸润+实验的生信文章“Comprehensive analysis of the correlation of the pan-cancer gene HAUS5 with prognosis and immune infiltration in liver cancer”,这篇文章于2023年2月10日发表在Scientific Reports期刊上,影响

免疫浸润结果分子分型(一致性聚类)

分子分型也是生信灌水的常见知识点之一。可以用于分子分型的方法非常多,比如:一致性聚类、非负矩阵分解、PCA等等,当然这些方法不需要我们手动去计算,都是有成熟的R包帮我们做。 比较常见的做分子分型的R包:ConsensusClusterPlus, cola, CancerSubtypes, MOVICS, diceR,等等。 可以用于分子分型的数据那更是五花八门啦,理论上只要你有一个数值型矩阵,

把美丽浸润到骨子里-农业大健康·万祥军:东温泉镇谋定变迁

把美丽浸润到骨子里-农业大健康·万祥军:东温泉镇谋定变迁 记者邓俐 通讯员田荣盛 新闻中国采编网 中国新闻采编网 谋定研究中国智库网 经信研究 国研智库 国情讲坛 哲商对话 万赢信采编:“设施建设是骨架,制度建设是血肉,文化建设是灵魂——近年来,东温泉镇通过设施、制度和文化三个层次建设美丽乡村,把美丽浸润进东温泉镇的骨子里。”全国工商联执委、中国经济和信息化研究中心主任、国家政策研究室中国国情研