taxa专题
R语言【taxlist】——merge_taxa()：整合概念和移除名称
Package taxlist version 0.2.4 Description 将分类概念合并为单个 taxlist 对象。 Usage merge_taxa(object, ...)## S3 method for class 'taxlist'merge_taxa(object, concepts, level, print_output = FALSE, ...)
R语言【taxa】——df_ref()：有效的 分类信息数据库
Package taxa version 0.4.2 Description 定义可以被 taxon_db 对象使用或使用 taxon_db 对象的有效分类数据库，例如 taxon_id 和 taxon。 使用 db_ref$get 查看数据库的详细信息。 用户可以使用 db_ref$set 创建自定义的数据库，并添加到数据库列表中
R语言【taxa】——roots()，stems()，subtaxa()，supertaxa()：获取根节点、茎节点、子类群和父类群
roots(x, subset = NULL) 在 taxonomy 中查找根节点类群的索引值。 > x <- taxonomy(c('Carnivora', 'Felidae', 'Panthera', 'Panthera leo',+ 'Panthera tigris', 'Ursidae', 'Ursus', 'Ursus arctos'
R语言【taxa】——n_subtaxa()，n_supertaxa()：每个类群的子类群数量和父类群数量
Package taxa version 0.4.2 n_subtaxa(x, subset = NULL, max_depth = NULL, include = FALSE) 参数【x】：获取子类群的对象，比如 taxonomy。 参数【subset】：检索的树的子集。索引或名称。 参数【max_depth】：挖掘的等级深度。比如，max_depth = 1 表示值返回直接子
R语言【taxa】——as_data_frame()：将 taxa 的对象 转换为 data.frame
Package taxa version 0.4.2 Description 将 taxa 对象包含的信息转换为 data.frame，信息保存在列中。如果使用 as_tribble 则转换为表格。 Usage as_data_frame(x,row.names = NULL,optional = FALSE,...,stringsAsFactors = FA