scatac专题

单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 整合

引言 在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。 加载包 首先加载 Signac、Seurat 和我们将用于分析人类数据的其他一些包。 if (!requireNamespace("EnsDb.Hsapiens.v75", quietly = TRUE))    BiocManager::install("Ens

scATAC-seq(Signic)官方分析流程

Analyzing PBMC scATAC-seq(官方教程 ) 分析由10x Genomics提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集 一、Signac的安装 & 加载流程中所有的安装包 install.packages("Signac")install.packages("BiocManager")install.packages("EnsDb.Hsapi