Sambamba是一个高性能，高度并行，健壮和快速的工具（和库），用D编程语言编写，用于处理SAM和BAM文件。与samtools相比，其优势在于并行BAM读和写。 conda安装 conda install sambamba -y# github: https://github.com/biod/sambamba 基本用法 # 创建.bai indexsamtools index s

sambamba — samtools 的高效平替工具 sambamba 是一个 BAM 文件处理工具。 sambamba 它使用了 D 语言的多线程和异步 IO 特性，实现了高效的并行化处理。sambamba 可以在多核 CPU 上同时运行多个任务，利用硬盘和内存的带宽，提高了处理速度。sambamba 还使用了一些优化算法和数据结构，比如快速排序，哈希表，位图等，减少了内存占用和磁