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QIIME 2 16S扩增子分析基础流程及常用命令(新手友好向)

整理了之前的QIIME 2 学习总结,挑选了非常基础实用的部分做一个QIIME 2 学习大礼包(没错就是这篇文章)。对基础分析的流程来说内容涵盖非常全。 我觉得很适合当作工具书来使用_(:з)∠)_ 如果有帮到你请给一个赞哦~👍 下载这篇文章的 PDF 版随时查阅:QIIME2扩增子分析流程及常用命令.pdf 以下是正文内容: 必看: QIIME 2 官方论坛(非常有用哦) 使用该

QIIME 2教程. 02插件工作流程Plugin Workflows(2020.11)

文章目录 QIIME 2插件工作流程概述**QIIME 2用户文档. 2插件工作流程概述**让我们定位:流程图给新人划重点QIIME 2分析流程概述样本拆分去噪和聚类去噪聚类特征表 物种分类和分类学分析序列分类注释多序列比对和进化树构建 多样性分析玩转特征表译者简介Reference猜你喜欢写在后面 QIIME 2插件工作流程概述 Overview of QIIME 2 Plu

QIIME 2教程. 02插件工作流程Plugin Workflows(2023.5)

QIIME 2插件工作流程概述 Overview of QIIME 2 Plugin Workflows 英文原文见:https://docs.qiime2.org/2023.5/tutorials/overview/ 正文共:9858 字 9 图 1 视频 预计阅读时间:25 分钟,视频时长 18 分钟 更新时间:2023年7月30日 本节即是对QIIME 2工作流程的概述,也是对扩增子分析过

QIIME 2教程. 06沙漠土壤分析AtacamaSoil(2023.5)

QIIME 2用户文档. 6阿塔卡马沙漠微生物组分析 原文地址:https://docs.qiime2.org/2023.5/tutorials/atacama-soils/ 此实例需要一些基础知识,要求完成本系列文章前两篇内容:《1简介和安装Introduction&Install》和《4人体各部位微生物组分析Moving Pictures》。 本教程设计用于两个目的。首先,它描述了对双端序

QIIME 2教程. 04人体微生物组分析Moving Pictures(2023.5)

QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组 “Moving Pictures” tutorial https://docs.qiime2.org/2023.5/tutorials/moving-pictures/ 本节1.6万字,14张图,1个视频。阅读时间大约40分钟。 注意:本文学习需要安装好QIIME 2,请务必完成1简介和安装Introduction&Install 在本教程中,

QIIME 2教程. 07Cell帕金森小鼠Parkinson's Mouse(2023.5,最佳实战)

QIIME 2用户文档. 7帕金森小鼠教程 Parkinson’s Mouse Tutorial 原文地址:https://docs.qiime2.org/2023.5/tutorials/pd-mice/ 本教程将使用来自人源化(humanized)小鼠的一组粪便样品,展示16S rRNA基因扩增子数据的“典型”QIIME 2分析。最初的研究,Sampson等,2016旨在确定粪便微生物组是否

QIIME 2教程. 07Cell帕金森小鼠Parkinson‘s Mouse(2020.11,最佳实战)

文章目录 QIIME 2用户文档. 7帕金森小鼠教程本节视频视频教程假设启动QIIME2运行环境元数据数据导入QIIME 2序列质量控制和特征表特征表摘要构建多样性分析所需的进化树Alpha稀疏和深度选择多样性分析Alpha多样性Beta多样性 物种注释物种组成柱状图ANCOM差异丰度分析下面部分视频教程再次物种分类纵向分析基于PCoA的分析基于距离的分析 用于预测样本特征的机器学习分类器合