multimer专题

PSP - 蛋白质结构预测 OpenFold Multimer 模型训练参数与配置

欢迎关注我的CSDN:https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址:https://spike.blog.csdn.net/article/details/132575709 OpenFold Multimer 是用于预测蛋白质多聚体结构的计算方法。基于OpenFold 的单体预测框架,利用深度学习技术,结合序列、进化和互作信息,来推断蛋白质之间的相互作用界面和空间

PSP - 蛋白质复合物 AlphaFold2 Multimer MSA Pairing 逻辑与优化

欢迎关注我的CSDN:https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址:https://spike.blog.csdn.net/article/details/134144591 在蛋白质复合物结构预测中,当序列 (Sequence) 是异源多链时,无论是AB,还是AABB,都需要 MSA 配对,即 MSA Pairing。在 MSA 的搜索过程中,按照单链维度进行搜索

AlphaFold-multimer 复合物结构预测

AlphaFold-multimer 复合物结构预测 AlphaFold-multimer是DeepMind开发的AlphaFold项目的一个扩展,旨在预测蛋白质多聚体的三维结构。蛋白质多聚体是由多个蛋白质亚单位相互组装而成的结构,如酶、膜蛋白复合物和病毒颗粒。理解多聚体的结构对于揭示蛋白质的功能和相互作用非常重要。 写在前面:不建议在个人电脑上安装AlphaFold,因为对算力的存储的要求