microrna专题

microRNA简介

microRNA简介 转录本的类型是多种多样的,除了编码蛋白的RNA外,还有很多非编码蛋白的RNA, noncoding RNA, 简称ncRNA。 在ncRNA中,根据长度又分成两类,长链非编码RNA, 指的是长度在200bp以上的非编码RNA, 缩写为lncRNA; 对于长度在50bp以下的RNA, 统称为small RNA。 small RNA包含了很多类型的小RNA, 比如miRNA,

TargetNet: Functional microRNA Target Prediction with Deep Neural Networks

出发点: MicroRNAs (miRNAs)通过与信使RNA(mRNA)的靶位点结合,在基因表达调控中发挥关键作用。因此识别miRNA的功能靶点至关重要,但是这个预测是一个巨大的挑战。以前的计算算法存在很大局限性,使用保守的候选目标位点(CTS)选择标准,主要侧重规范位点类型,依赖费力且耗时的人工特征提取,没有充分利用miRNA-CTS相互作用的基础信息。 结果 本文章,作者提出了一种新的

linux质控命令,Linux下microRNA质控-cutadapt安装

如果Linux系统已安装pip或conda,cutadapt的安装相对简便一些,示例如下: 1.pip安装 pip install --user --upgrade cutadapt 添加环境变量 echo 'export PATH=$PATH:/your path/cutadapt-1.10/bin ' >> ~/.bashrc 2.conda安装 conda install -c bioco

【拓扑排序】MicroRNA Ranking

题目描述 Ahlaam is a computer science student, doing her master thesis on a bioinformatics project about MicroRNAs, special molecule types found in cells. During her thesis, she wants to find microRNAs r

Signal Transducers and Activators of Transcription-1 (STAT1) Regulates microRNA Transcription in

Signal Transducers and Activators of Transcription-1(STAT1) Regulates microRNA Transcription in Interferon c-Stimulated HeLa Cells 部分翻译 结论      为了了解在γ干扰素刺激下的海拉细胞内以小RNA为介导的调控网络作用,我们对RNA聚合酶II和STAT1

MicroRNA 详解

MicroRNA研究历史和方法                     Views  88 1Report 转载于:https://www.cnblogs.com/think-and-do/p/6940204.html