本文主要是介绍microRNA简介,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
microRNA简介
转录本的类型是多种多样的,除了编码蛋白的RNA外,还有很多非编码蛋白的RNA, noncoding RNA, 简称ncRNA。 在ncRNA中,根据长度又分成两类,长链非编码RNA, 指的是长度在200bp以上的非编码RNA, 缩写为lncRNA; 对于长度在50bp以下的RNA, 统称为small RNA。
small RNA包含了很多类型的小RNA, 比如miRNA, siRNA等,其中miRNA是研究的最为官方,最为成熟的小RNA。
miRNA是一类长度在18到36bp的非编码RNA, 关于miRNA长度的范围有很多说法,也有说是20到24bp之间的,大部分miRNA的长度在21或者22bp左右,miRNA的形成过程如下
首先由miRNA gene转录生成初级miRNA转录本,简称pri-miRNA, pri-miRNA的长度在300到10kbp之间,然后进一步加工生成带有茎环结构stem-loop的miRNA前体,简称pre-miRNA, pre-miRNA长度在70到90bp之间,最后在Dicer
酶切作用下,从pre-miRNA的5’端和3’端分别剪切形成成熟的miRNA, 即mature miRNA, 所以一个pre-miRNA可能产生两个成熟的miRNA。
关于miRNA的作用机制,研究的也比较清楚。miRNA的功能属于转录后修饰调控,主要通过和mRNA的3’UTR区进行结合,结合区域称之为seed
,当结合区域的序列完全配对时,诱导mRNA降解, 当只有部分序列配对时,抑制mRNA的翻译,从而发挥一个负调控的机制, 示意图如下
对于miRNA而言,除了研究其表达水平上的组织特异性,时间,空间特异性之外,miRNA靶标基因的研究也是重要的一环,由于miRNA研究起步早,研究热度高,有很多数据库可供参考,在后续文章中会详细介绍。
需要注意的地方:
即:pri-miRNA(转录本), pre-miRNA(前体) 和 mature miRNA(成熟体)的区别
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pri-miRNA:成熟的miRNAs是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRNA。pri-miRNA长度从几百到几千个碱基不等,带有5‘帽子和3’polyA尾巴,以及1到数个发夹径环结构。
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pre-miRNA:pri-miRNA经剪切产生约70个碱基的miRNA前体,即pre-miRNA。pre-miRNA为单一发夹结构,5‘带有磷酸基团,3’有两个突出碱基,并带有3‘羟基。
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mature miRNA:pre-miRNA经进一步剪切,形成长度约为22个碱基的单链成熟miRNA。
接下来本博客将随着我了解的程度不断丰富,附上参考链接:
参考资料来源:
作者:生信修炼手册
链接:https://www.jianshu.com/p/170ac01fbf5a
来源:简书
作者:CSDN博主Nabla_
原文链接:https://blog.csdn.net/Nabla_/article/details/98470392
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