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摘要|临床宏基因组下一代测序（mNGS）是对患者样本中微生物和宿主遗传物质（DNA和RNA）的综合分析，目前正迅速从研究向临床实验室发展。这种新兴的方法正在改变医生诊断和治疗传染病的方式，其应用涉及广泛的领域，包括抗菌素耐药性、微生物组、人类宿主基因表达（转录组学）和肿瘤学。在这里，我们重点关注在临床实验室实施mNGS的挑战，并解决潜在的解决方案，以最大限度地提高其对患者护理和公共