特定功能微生物多样性分析

2024-04-11 02:32
文章标签 分析 功能 微生物 特定 多样性

本文主要是介绍特定功能微生物多样性分析，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！

——基于功能基因/持家基因/靶基因

在自然界的各类环境中，都有微生物的存在，它们在各自的“岗位”上都发挥着或大或小、或多或少的作用。有一些具有特殊功能的微生物，由于其作用的重要性或特殊性而受到人们的广泛关注，这些具有特殊功能的微生物叫做功能微生物，如氨氧化细菌、硫细菌、硝化细菌等。它们在分类学上有可能差异很大，但却具有相同或类似的基因使其能够发挥同样的作用。支配这些功能细菌发挥重要功能的基因被称为功能基因，如amoA、dsrB、nxrA。目前微基生物已收集GeneBank中所有已知功能基因的序列及其对应的种属信息，构建自己的功能基因数据库。 

 微基生物可根据客户需求，针对功能基因或持家基因，设计PCR通用引物，开展个性化建库及分析。 此类方法，可针对属内各种，甚至亚种，进行细致地分类及分析，并与环境数据相结合，可用于某类微生物精细的分类及进化研究。部分已完成功能基因建库分析及引物列表（其他功能基因请垂询）。

功能微生物

测序基因

特异引物

推荐平台

产甲烷菌

16S rRNA gene

Arch519F / Arch915R

MiSeq 2×300

硫酸盐还原菌SRB

dsrB

dsrF / dsrR

MiSeq 2×300

硝化细菌AOB

这篇关于特定功能微生物多样性分析的文章就介绍到这儿，希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助！


http://www.chinasem.cn/article/892840。

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