生信技能40 - Clinvar数据库VCF文件下载和关键信息提取

2024-03-05 04:44

文章标签 数据库关键下载 40 技能信息提取生信 vcf clinvar

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Clinvar 下载VCF文件

# 后台下载最新版本VCF
wget -c -b https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/clinvar/vcf_GRCh37/clinvar_20240301.vcf.gz# 解压
gzip -d clinvar_20240301.vcf.gz

读取Clinvar VCF文件

# vcf文件路径
clinvar_vcf = "clinvar_20240301.vcf"
df_clinvar_vcf= pd.read_csv(clinvar_vcf , sep

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官网链接： https://github.com/airockchip/rknn-toolkit2 安装好git：[[1. Git的安装]] 下载项目： git clone https://github.com/airockchip/rknn-toolkit2.git 或者直接去github下载压缩文件，解压即可。

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