生信技能36 - 获取染色体短臂、长臂和跨短臂长臂的全部区带列表

2024-01-16 22:20

本文主要是介绍生信技能36 - 获取染色体短臂、长臂和跨短臂长臂的全部区带列表,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

如何获取CNV开始位置和结束位置所在的染色体区带,可以参考以下本人文章,本程序涉及的cytoBand.txt与上述文章中cytoBand.txt一致。
生信技能30 - 获取CNV开始位置和结束位置所在的染色体区带

人类染色体的区带命名可以参考以下文章:
人类染色体命名的国际规则 (ISCN)

主程序方法(python)

如输入region = ‘p15.32->p15.2’, 可以输出区域内染色体上全部区带的名称,列表形式返回; 输入chrom = ‘chr1’, 可以返回1号染色体上全部区带的名称,同样以列表形式返回。

# 根据染色体编号和染色体区带获取全部区带列表
def getAllCytoBand(chrom: str, region: str

这篇关于生信技能36 - 获取染色体短臂、长臂和跨短臂长臂的全部区带列表的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/614087

相关文章

golang获取prometheus数据(prometheus/client_golang包)

《golang获取prometheus数据(prometheus/client_golang包)》本文主要介绍了使用Go语言的prometheus/client_golang包来获取Prometheu... 目录1. 创建链接1.1 语法1.2 完整示例2. 简单查询2.1 语法2.2 完整示例3. 范围值

javaScript在表单提交时获取表单数据的示例代码

《javaScript在表单提交时获取表单数据的示例代码》本文介绍了五种在JavaScript中获取表单数据的方法:使用FormData对象、手动提取表单数据、使用querySelector获取单个字... 方法 1:使用 FormData 对象FormData 是一个方便的内置对象,用于获取表单中的键值

Python如何计算两个不同类型列表的相似度

《Python如何计算两个不同类型列表的相似度》在编程中,经常需要比较两个列表的相似度,尤其是当这两个列表包含不同类型的元素时,下面小编就来讲讲如何使用Python计算两个不同类型列表的相似度吧... 目录摘要引言数字类型相似度欧几里得距离曼哈顿距离字符串类型相似度Levenshtein距离Jaccard相

如何利用Java获取当天的开始和结束时间

《如何利用Java获取当天的开始和结束时间》:本文主要介绍如何使用Java8的LocalDate和LocalDateTime类获取指定日期的开始和结束时间,展示了如何通过这些类进行日期和时间的处... 目录前言1. Java日期时间API概述2. 获取当天的开始和结束时间代码解析运行结果3. 总结前言在J

java获取图片的大小、宽度、高度方式

《java获取图片的大小、宽度、高度方式》文章介绍了如何将File对象转换为MultipartFile对象的过程,并分享了个人经验,希望能为读者提供参考... 目China编程录Java获取图片的大小、宽度、高度File对象(该对象里面是图片)MultipartFile对象(该对象里面是图片)总结java获取图片

Java通过反射获取方法参数名的方式小结

《Java通过反射获取方法参数名的方式小结》这篇文章主要为大家详细介绍了Java如何通过反射获取方法参数名的方式,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录1、前言2、解决方式方式2.1: 添加编译参数配置 -parameters方式2.2: 使用Spring的内部工具类 -

Java如何获取视频文件的视频时长

《Java如何获取视频文件的视频时长》文章介绍了如何使用Java获取视频文件的视频时长,包括导入maven依赖和代码案例,同时,也讨论了在运行过程中遇到的SLF4J加载问题,并给出了解决方案... 目录Java获取视频文件的视频时长1、导入maven依赖2、代码案例3、SLF4J: Failed to lo

Redis存储的列表分页和检索的实现方法

《Redis存储的列表分页和检索的实现方法》在Redis中,列表(List)是一种有序的数据结构,通常用于存储一系列元素,由于列表是有序的,可以通过索引来访问元素,因此可以很方便地实现分页和检索功能,... 目录一、Redis 列表的基本操作二、分页实现三、检索实现3.1 方法 1:客户端过滤3.2 方法

使用Java实现获取客户端IP地址

《使用Java实现获取客户端IP地址》这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用Java实现获取客户端IP地址,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 首先是获取 IP,直接上代码import org.springframework.web.context.request.Requ

Java实现Elasticsearch查询当前索引全部数据的完整代码

《Java实现Elasticsearch查询当前索引全部数据的完整代码》:本文主要介绍如何在Java中实现查询Elasticsearch索引中指定条件下的全部数据,通过设置滚动查询参数(scrol... 目录需求背景通常情况Java 实现查询 Elasticsearch 全部数据写在最后需求背景通常情况下