Snakemake:初探

2024-01-16 20:52
文章标签 初探 snakemake

本文主要是介绍Snakemake:初探,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

我已经安装了mamba(没有的话可以这样试试)

curl -L https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Mambaforge-Linux-x86_64.sh -o Mambaforge-Linux-x86_64.sh
bash Mambaforge-Linux-x86_64.sh

安装snakemake

Setup - Snakemake 8.1.3 documentation

#建立目录
mkdir snakemake-tutorial
cd snakemake-tutorial
curl -L https://api.github.com/repos/snakemake/snakemake-tutorial-data/tarball -o snakemake-tutorial-data.tar.gz
tar --wildcards -xf snakemake-tutorial-data.tar.gz --strip 1 "*/data" "*/environment.yaml"
mamba env create --name snakemake-tutorial --file environment.yaml
conda activate snakemake-tutorial
snakemake --help

 

这篇关于Snakemake:初探的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/613864

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