CIRCOS教程翻译 2.6——spacing

2024-01-05 15:32
文章标签 教程 翻译 2.6 circos spacing

本文主要是介绍CIRCOS教程翻译 2.6——spacing,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

染色体之间的间隔也可以控制,根据上一节文件,来配置主配置文件和spacing文件:

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>><<include ideogram.conf>>
<<include ticks.conf>><image>
<<include etc/image.conf>>
</image>karyotype   = data/karyotype/karyotype.human.txtchromosomes_units           = 1000000
chromosomes_display_default = nochromosomes        = hs1:0-200;hs2;hs3;hs4
chromosomes_breaks = -hs1:51-149;-hs2:0-49;-hs2:151-);-hs3:0-99;-hs4:51-149 #这些上一节已经翻译过 
<<include etc/housekeeping.conf>>
<ideogram><spacing>default = 0.005r
break   = 0.5r #添加默认的break大小<<include break.conf>><pairwise hs1 hs2> #也可以用,;等分割两个不同的染色体,只能小于等于2,3以上的测试没成功。。。
spacing = 0.25r
</pairwise><pairwise hs3> #表示在3号染色体周围的间距为10M大小
spacing = 10u
</pairwise></spacing><<include ideogram.position.conf>>
<<include ideogram.label.conf>>
<<include bands.conf>></ideogram>



这篇关于CIRCOS教程翻译 2.6——spacing的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/573329

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