CIRCOS教程翻译 2.4——order

2024-01-05 15:32
文章标签 2.4 教程 翻译 order circos

本文主要是介绍CIRCOS教程翻译 2.4——order,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

为染色体排序,博主认为这个不是很重要,要记那么多模式,还不累死啊!还不如老老实实地直接写全比较好,当然心有余力怎么着都行,主配置文件有变化:

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>><<include ideogram.conf>>
<<include ticks.conf>><image>
<<include etc/image.conf>>
</image>karyotype   = data/karyotype/karyotype.human.txtchromosomes_units           = 1000000
chromosomes_display_default = nochromosomes                 = hs1;hs2;hs3;hs4;hs5;hs6;hs7;hs8chromosomes_order           = hs2,hs3,hs1,hs5,hs4,hs8,hs7,hs6 绝对顺序排列,显示2,3,1,5,4,8,7,6#chromosomes_order = hs5,hs4 相对位置显示1,2,3,6,5,4,7,8,惊讶?其实跟circos的设置有关,具体见英文教程,真心不想翻译这个。。。#chromosomes_order = ^,hs4,|,hs1,$ 显示4,2,3,5,6,7,8,1,^定位开头,$定位结尾,|为分组(4为一组,1为一组)#chromosomes_order = hs3,-,hs2 显示4,5,3,1,2,6,7,8,-代表下一个,理解有些困难,先是3为定位,4、5排在3前(见英文教程),然后显示3,1,2,最后按顺序来<<include etc/housekeeping.conf>>


 

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