LA - 3602 - DNA Consensus String

2023-11-03 13:08
文章标签 dna string consensus la 3602

本文主要是介绍LA - 3602 - DNA Consensus String,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

题意:有m个长度为n的ACGT序列,求一个长度为n的序列,使得每一位与这m个序列相应位的距离和最小(相同为0,不同为1)(4 <= m <= 50, 4 <= n <= 1000)。

题目链接:https://icpcarchive.ecs.baylor.edu/index.php?option=com_onlinejudge&Itemid=8&page=show_problem&category=19&problem=1603

——>>统计每一位A、C、G、T出现的次数,取出现最多的。

#include <cstdio>
#include <cstring>using namespace std;const int maxn = 1000 + 10;int main()
{int A[maxn], C[maxn], G[maxn], T[maxn], t, m, n, i, j;char s[maxn];scanf("%d", &t);while(t--){scanf("%d%d", &m, &n);memset(A, 0, sizeof(A));memset(C, 0, sizeof(C));memset(G, 0, sizeof(G));memset(T, 0, sizeof(T));for(j = 0; j < m; j++){scanf("%s", s);for(i = 0; i < n; i++){switch(s[i]){case 'A':{A[i]++;break;}case 'C':{C[i]++;break;}case 'G':{G[i]++;break;}case 'T':{T[i]++;break;}}}}char ret[maxn];int cnt = 0;for(i = 0; i < n; i++){int Max = -1, num;if(A[i] > Max){Max = A[i];ret[i] = 'A';num = A[i];}if(C[i] > Max){Max = C[i];ret[i] = 'C';num = C[i];}if(G[i] > Max){Max = G[i];ret[i] = 'G';num = G[i];}if(T[i] > Max){Max = T[i];ret[i] = 'T';num = T[i];}cnt += m - num;}for(i = 0; i < n; i++) putchar(ret[i]);printf("\n");printf("%d\n", cnt);}return 0;
}


这篇关于LA - 3602 - DNA Consensus String的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/338368

相关文章

string字符会调用new分配堆内存吗

gcc的string默认大小是32个字节,字符串小于等于15直接保存在栈上,超过之后才会使用new分配。

OBItools:Linux下的DNA条形码分析神器

在生物信息学领域,DNA条形码分析是一种非常常见的研究方法,用于物种鉴定、生态学和进化生物学研究。今天要介绍的工具就是专为此设计的——OBItools。这个工具集专门用于处理生态学和进化生物学中的DNA条形码数据,在Linux环境下运行。无论你是本科生还是刚入门的科研人员,OBItools都能为你提供可靠的帮助。 OBItools的功能亮点 OBItools是一个强大的工具包,特别适合DNA条形

hdu2072(string的应用)

单词数 Time Limit: 1000/1000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others) Total Submission(s): 25447    Accepted Submission(s): 5957 Problem Description lily的好朋友xiaoou333最近很空,他

【UVA】10739 - String to Palindrome(动态规划)

比较水的动态规划 dp[i][j] 将原串 i ~ j 之内的字符转化为回文字符所需要的最小操作次数 其中删除操作和添加操作本质上是一样的。 三个状态转移方程: dp[i][j] = min(dp[i][j] ,dp[i + 1][j]); dp[i][j] = min(dp[i][j] ,dp[i + 1][j - 1]); dp[i][j] = min(dp[i][j] ,dp[

理解String的compareTo()方法返回值

compareTo()的返回值是整型,它是先比较对应字符的大小(ASCII码顺序), 如果第一个字符和参数的第一个字符不等,结束比较,返回他们之间的差值。 如果第一个字符和参数的第一个字符相等,则以第二个字符和参数的第二个字符作比较, 以此类推,直至比较的字符或被比较的字符有一方全比较完,这时就比较字符的长度。 我们可以通过阅读源码加深对compareTo()的理解: comp

【JavaScript】基本数据类型与引用数据类型区别(及为什么String、Boolean、Number基本数据类型会有属性和方法?)

基本数据类型   JavaScript基本数据类型包括:undefined、null、number、boolean、string。基本数据类型是按值访问的,就是说我们可以操作保存在变量中的实际的值。 1)基本数据类型的值是不可变的 任何方法都无法改变一个基本类型的值,比如一个字符串: var name = "change";name.substr();//hangconsole.log

leetcode#541. Reverse String II

题目 Given a string and an integer k, you need to reverse the first k characters for every 2k characters counting from the start of the string. If there are less than k characters left, reverse all of

Java中Map取值转String Null值处理

Map<String, Object> 直接取值转String String value = (String)map.get("key") 当map.get(“key”)为Null值时会报错。 使用String类的valueOf静态方法可以解决这个问题 String value = String.valueOf(map.get("key"))

Qt的QString和C++string之间的转换

QString qstr; string str; //将QString转化为C++的string str = qstr.toStdString(); //将C++的string转化为QString qstr = QString::fromStdString(str);