计算机生物学与定量遗传学,科学网—中医理论与系统生物学 - 图解 - 曾杰的博文...

- 系统与合成(synthetic)生物学

A

1991年-2002年J. Zeng(Tseng)的论述 - 包括生物系统论、系统生物工程和实验生物学、计算生物(信息)学与工程(基因和仿生)方法的生物系统与人工生物系统(genomic intelligence & artificial biosystem)研究：

EXPLORING OF GENOTYPE - PHENOTYPE COMPLEXITY

1)系统生物科学与工程(BSSE)

2)系统医学与遗传学，从概念、方法(The Positive and Synthetic Thoughts of Organisms)到机理的基础与应用阴阳偶合概念。

(结构论模型，另有系统医学模型图，1999年Biosystem Network和10月Nature刊登链接)

又是分子、细胞到器官系统的天然与人工生物系统阴阳偶合概念。

而是系统理论与生物系统的方法与对象偶合和实验技术、计算模型(Biotechnology & Bio-computation)和工程设计(computational, experimental and engineering manipulation of biosystems)的3角鼎立概念。

(细胞计算机概念，另有1999年细胞通讯分子电路概念图)

B

然后，看国际上 - 1999年H. Kitano在计算生物学中重提系统生物学，2000年E. Kool在人工DNA合成中重提合成生物学，2003年国际学界共识 - 系统生物学为系统理论和实验、计算方法的生物系统研究，合成生物学是系统生物学工程方法的人工生物系统研究：

(2002年H. Kitano的技术与计算阴阳概念)

(2003年L. Hood的技术、计算与生物学概念)

(R. Weiss的合成生物学概念)

(AL. Barabási的生物网络概念)

(系统科学与系统生物学概念)

(2009年D di Bernardo的系统与合成生物学阴阳概念)

(U. Alon的合成生物学概念)

实际上，系统与合成生物学就是一个1)系统理论与2)生物系统和3)实验技术、4)计算模型与5)工程设计的阴阳五行概念并构成5个学派，在细节上是图论的网络拓扑学(Network Topology)等，涉及理论(数学)科学 –计算机软件与定量模型，实验科学-物理(纳米)、化学(合成)、生物(组学)学的分子系统、细胞通讯网络能量、物质和信息研究，及工程(应用)科学-技术方法和设计艺术的结合等。